28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2655 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2655  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  269  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0915  hypothetical protein  29.17 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 570 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.46 
 
 		 565 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.46 
 
 		 565 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  32.22 
 
 		 584 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 562 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  29.47 
 
 		 563 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4174  hypothetical protein  36.07 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 551 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2447  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  28.45 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0891064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3298  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  32.91 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  24.68 
 
 		 568 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2794  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  33.33 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  31.43 
 
 		 524 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 		 615 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 559 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.68 
 
 		 114 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  26.55 
 
 		 609 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0113  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-[acyl- carrier-protein] dehydratase  27.14 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 563 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2747  hypothetical protein  32.47 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.168123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1985  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.86 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03840  hypothetical protein  27.38 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189773  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 563 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  27.69 
 
 		 609 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4507  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  35.48 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2847  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  33.87 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>