65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0442 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0442  thioester dehydrase family protein  100 
 
 		 137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0336  thioester dehydrase family protein  85.4 
 
 		 134 aa  235  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0346  thioester dehydrase family protein  85.4 
 
 		 134 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  84.67 
 
 		 134 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0338  thioester dehydrase family protein  84.67 
 
 		 134 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4372  thioester dehydrase family protein  83.62 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  82.76 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  82.76 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  81.9 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4600  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  66.39 
 
 		 125 aa  164  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3383  thioester dehydrase family protein  69.64 
 
 		 120 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3892  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  60.98 
 
 		 128 aa  157  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0321  thioester dehydrase family protein  58.68 
 
 		 125 aa  157  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3515  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  62.3 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0348  thioester dehydrase family protein  57.69 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  42.11 
 
 		 563 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  42.55 
 
 		 561 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  45.28 
 
 		 559 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  41.82 
 
 		 524 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  38.53 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2099  hypothetical protein  38.26 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004068  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  38.39 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4573  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  39.81 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 565 aa  73.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 615 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 562 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 568 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 		 557 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 563 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 557 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 557 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4805  putative (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  35 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3890  putative (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  37.37 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 563 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 551 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0113  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-[acyl- carrier-protein] dehydratase  31.19 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 593 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  28.57 
 
 		 563 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  31.78 
 
 		 591 aa  52  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3298  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  33.98 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1728  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.84 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.770808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4758  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.9 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.12941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2747  hypothetical protein  32.93 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.168123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0436  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  27.55 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.28393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  32.58 
 
 		 580 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4174  hypothetical protein  25.81 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2009  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  32.46 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.133572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3988  hypothetical protein  32.26 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5454  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0677  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.67 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.09 
 
 		 518 aa  41.6  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5399  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000134104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5551  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963148  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4961  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.28459e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5401  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000205722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5076  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000655329  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1586  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  26.44 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000412753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2745  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  25.96 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000138832  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  30.11 
 
 		 590 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  30.11 
 
 		 590 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 570 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.18 
 
 		 565 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1847  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.39 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000663775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3797  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000652918  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.21 
 
 		 565 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>