65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0321 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0321  thioester dehydrase family protein  100 
 
 		 125 aa  257  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4600  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  73.17 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  63.79 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  63.79 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3892  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  65.52 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  62.93 
 
 		 124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0338  thioester dehydrase family protein  62.5 
 
 		 134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0346  thioester dehydrase family protein  62.5 
 
 		 134 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  62.5 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4372  thioester dehydrase family protein  62.07 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0336  thioester dehydrase family protein  61.61 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3383  thioester dehydrase family protein  63.79 
 
 		 120 aa  157  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0442  thioester dehydrase family protein  58.68 
 
 		 137 aa  157  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0348  thioester dehydrase family protein  62.18 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3515  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  60 
 
 		 123 aa  151  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  40.52 
 
 		 559 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  40.87 
 
 		 524 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 		 563 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2099  hypothetical protein  41.94 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 		 561 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  41.76 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004068  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  36.17 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 562 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 565 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4573  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.92 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 615 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 557 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 551 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 568 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3890  putative (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  32.17 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 		 563 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0436  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.18 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.28393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4805  putative (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  33.33 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  26.47 
 
 		 563 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 557 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 557 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0113  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-[acyl- carrier-protein] dehydratase  28.42 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  35.63 
 
 		 518 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 		 593 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  29.17 
 
 		 591 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  24.76 
 
 		 563 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.82 
 
 		 518 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  34.88 
 
 		 580 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1728  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.59 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.770808  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  35.05 
 
 		 584 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4758  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.58 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.12941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38880  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.4 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1494  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.95 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17190  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.95 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2332  3-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase  26.58 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1985  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2110  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  25.44 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.689445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  31.96 
 
 		 609 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1354  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  31 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3988  hypothetical protein  30.68 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0666  cylZ protein  22.4 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1279  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  30.95 
 
 		 471 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  31.91 
 
 		 609 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  30.93 
 
 		 590 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0289  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  32.76 
 
 		 464 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.013446 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  30.93 
 
 		 590 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3042  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.57 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1037  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  30.77 
 
 		 462 aa  40  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0742061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4071  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.37 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.9 
 
 		 565 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>