55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004068 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004068  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  100 
 
 		 122 aa  257  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2099  hypothetical protein  52.42 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  46.55 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4805  putative (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  44.14 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3890  putative (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  43.24 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4573  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  43.64 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  40.87 
 
 		 559 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4600  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  41.49 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  35.9 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 561 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  35.9 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  39.29 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0336  thioester dehydrase family protein  37.5 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0338  thioester dehydrase family protein  39.29 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  35.04 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0346  thioester dehydrase family protein  38.39 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4372  thioester dehydrase family protein  35.04 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0442  thioester dehydrase family protein  38.39 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 565 aa  76.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  35.96 
 
 		 524 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  39.45 
 
 		 563 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 557 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0321  thioester dehydrase family protein  36.17 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3515  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  39.36 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3892  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.93 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 		 615 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3383  thioester dehydrase family protein  34.48 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 562 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 568 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 563 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 563 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0348  thioester dehydrase family protein  33.04 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 557 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 557 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  31.17 
 
 		 563 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 551 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0113  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-[acyl- carrier-protein] dehydratase  28.74 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  29.41 
 
 		 591 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  30.61 
 
 		 593 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0677  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  32.99 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3122  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.56 
 
 		 143 aa  42  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163711  unclonable  0.0000143605 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15361  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.35 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3779  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  27.45 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301111  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0236  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  35.44 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2956  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.56 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.744837  hitchhiker  0.000492174 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05511  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.06 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0907  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.24 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.64908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17631  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.24 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14971  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  31.58 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0915  hypothetical protein  30.34 
 
 		 132 aa  40  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0249  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 151 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0265  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 151 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0253  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 151 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.68126  normal  0.786881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0268  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 151 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000119785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0249  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 		 151 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  normal  0.763998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>