63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4600 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4600  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  100 
 
 		 125 aa  259  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0321  thioester dehydrase family protein  73.17 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0336  thioester dehydrase family protein  69.23 
 
 		 134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0346  thioester dehydrase family protein  68.38 
 
 		 134 aa  170  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0338  thioester dehydrase family protein  68.38 
 
 		 134 aa  170  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  68.97 
 
 		 124 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  68.97 
 
 		 124 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3892  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  66.1 
 
 		 128 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  68.38 
 
 		 134 aa  169  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  68.1 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4372  thioester dehydrase family protein  67.24 
 
 		 124 aa  167  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3515  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  64.35 
 
 		 123 aa  166  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0442  thioester dehydrase family protein  66.39 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3383  thioester dehydrase family protein  65.52 
 
 		 120 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0348  thioester dehydrase family protein  60.48 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 559 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 		 563 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  41.28 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  38.39 
 
 		 524 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004068  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  41.49 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 561 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2099  hypothetical protein  38.46 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 562 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4573  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  36.97 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 565 aa  71.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 563 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 557 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 563 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 551 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4805  putative (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  35.4 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3890  putative (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  36.27 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 568 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 557 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 557 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0436  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.84 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.28393  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0113  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-[acyl- carrier-protein] dehydratase  29.35 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  26.21 
 
 		 593 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  27.45 
 
 		 563 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  28.16 
 
 		 518 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.46 
 
 		 518 aa  47.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1728  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.86 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.770808  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 570 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  32.58 
 
 		 580 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1985  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.29 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3988  hypothetical protein  28.12 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  27.08 
 
 		 591 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2332  3-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase  27.63 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0915  hypothetical protein  29.55 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1359  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.84 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691749  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0677  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  25 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4758  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.85 
 
 		 145 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.12941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2610  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  30.3 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0289  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  22.88 
 
 		 464 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.013446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3298  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  33.78 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2110  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  22.52 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.689445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1354  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.11 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0113  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.25 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000598589  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2135  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.27 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000114205  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2173  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.27 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000210444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4174  hypothetical protein  29.55 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1850  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  25.71 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000011259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3097  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.77 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000414078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>