More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0971 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  100 
 
 		 518 aa  1052    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  56.7 
 
 		 518 aa  591  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  32.94 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  30.15 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 563 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 		 551 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  25.47 
 
 		 557 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  25.47 
 
 		 557 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 615 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 		 562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.3 
 
 		 568 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  26.54 
 
 		 563 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  26.52 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  27.42 
 
 		 563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 		 563 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 565 aa  128  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  28.54 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  26.45 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  29.23 
 
 		 454 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  29.23 
 
 		 454 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  29.23 
 
 		 454 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  29.25 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  29.85 
 
 		 459 aa  114  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  29.5 
 
 		 453 aa  114  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  29.54 
 
 		 454 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  28.31 
 
 		 454 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  28.26 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  28.26 
 
 		 454 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  28.26 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  28.05 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  29.33 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  28.78 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  30.49 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  24.82 
 
 		 591 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  27.33 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  24.36 
 
 		 570 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 		 453 aa  97.4  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  24.8 
 
 		 565 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  24.32 
 
 		 448 aa  87.4  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  24.02 
 
 		 593 aa  83.6  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.78 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  24.56 
 
 		 580 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  22.6 
 
 		 584 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  24.38 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  22.53 
 
 		 609 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  21.67 
 
 		 609 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  26.63 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  22.93 
 
 		 590 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  22.93 
 
 		 590 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01340  AAS bifunctional protein  25.47 
 
 		 710 aa  70.1  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0141  AMP-dependent synthetase and ligase  23.89 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000366102 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  24.26 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  24.92 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  23.81 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00356403  decreased coverage  0.0000000268145 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0766  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  25.35 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118074  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  24.05 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  27.07 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  23.53 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  26.15 
 
 		 501 aa  62  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  26.7 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1780  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  25.67 
 
 		 1138 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324792 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  23.38 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  23.76 
 
 		 4502 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  24.85 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  25.34 
 
 		 2606 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  21.88 
 
 		 547 aa  60.1  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  21.82 
 
 		 539 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  25.1 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4512  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  23.4 
 
 		 1139 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  23.84 
 
 		 5654 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0910  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  26.05 
 
 		 1137 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.0715887 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1674  AMP-dependent synthetase and ligase  22.69 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  23.99 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1501  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  25.29 
 
 		 1138 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  22.84 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1502  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  25.67 
 
 		 1138 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.780904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3554  AMP-dependent synthetase and ligase  23.28 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.144177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  23.26 
 
 		 880 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  23.95 
 
 		 555 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3617  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  24.29 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  25.88 
 
 		 2596 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0113  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-[acyl- carrier-protein] dehydratase  38.04 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  23.34 
 
 		 1130 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  24 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  26.99 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  21.73 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  22.72 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  22.28 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  23.95 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  22.72 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  27.12 
 
 		 2338 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1593  non-ribosomal peptide synthase  22.4 
 
 		 1346 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  23.86 
 
 		 508 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  23.75 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0187  syringopeptin synthetase C  22.4 
 
 		 1345 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  23.35 
 
 		 507 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  23.3 
 
 		 5149 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>