More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0115 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  100 
 
 		 427 aa  877    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  36.3 
 
 		 524 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 559 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.94 
 
 		 518 aa  184  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  34.27 
 
 		 459 aa  179  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  35.22 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  34.73 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  32.16 
 
 		 518 aa  170  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  31.74 
 
 		 466 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  34.03 
 
 		 454 aa  169  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  33.57 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  33.57 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  34.27 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  33.57 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  34.27 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  34.27 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  34.5 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  33.64 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  32.01 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  33.18 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  31 
 
 		 454 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  34.59 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  29.75 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 551 aa  146  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 562 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  32.82 
 
 		 563 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 557 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 557 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 565 aa  143  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 557 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 568 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 561 aa  131  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  31.89 
 
 		 591 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 563 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 563 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.23 
 
 		 615 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  27.04 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.66 
 
 		 565 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  27.22 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  27.78 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 570 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.93 
 
 		 565 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  27.38 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  25.93 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  26.4 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  26.35 
 
 		 590 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  26.35 
 
 		 590 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  27.73 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  27.41 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  30.04 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  25.93 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  28.21 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  26.23 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  25 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  24.29 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  21.11 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  23.66 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  22.44 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  23.66 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  23.66 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  21.11 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  25.57 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  22.81 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 		 544 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6285  AMP-dependent synthetase and ligase  20.2 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.586819  normal  0.531753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2630  acyl-CoA synthetase  24.29 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.261373  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  22.73 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3344  acyl-CoA synthetase  22.22 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  hitchhiker  0.0000000000000207537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  22.64 
 
 		 555 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1985  acyl-CoA synthetase  22.22 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  23.51 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  22.1 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  23.6 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  24.43 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  24.77 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0799  hypothetical protein  23.36 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.39313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0905  AMP-dependent synthetase and ligase  22.46 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3973  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.72 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2018  acyl-CoA synthetase  21.92 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.75082e-44 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  21.95 
 
 		 575 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1846  acyl-CoA synthetase  22.52 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.259612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1840  acyl-CoA synthetase  21.62 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  21.71 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1983  acyl-CoA synthetase  21.62 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  21.29 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  21.41 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1814  acyl-CoA synthetase  21.39 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0396009  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  21.47 
 
 		 576 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  22.16 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  23.68 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  21.75 
 
 		 524 aa  56.6  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  22.82 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  22.43 
 
 		 555 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  21.79 
 
 		 519 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  21.27 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>