248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3889 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
453 aa  924    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  49.78 
 
 
451 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  43.78 
 
 
457 aa  342  9e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  35.7 
 
 
466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  35.14 
 
 
457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  32.75 
 
 
454 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  35.13 
 
 
459 aa  210  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  34.06 
 
 
454 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  34.06 
 
 
454 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  33.84 
 
 
454 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  32.1 
 
 
454 aa  207  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  33.19 
 
 
454 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  33.19 
 
 
454 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  35.02 
 
 
454 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  33.19 
 
 
454 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  34.27 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  33.19 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  31.86 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  34.16 
 
 
563 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  32.55 
 
 
459 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 
562 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  30.85 
 
 
455 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 
557 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 
557 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  33.25 
 
 
557 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 
559 aa  186  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  35.44 
 
 
524 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 
563 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 
568 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 
563 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 
563 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 
565 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 
561 aa  167  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
551 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 
615 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  32.05 
 
 
427 aa  145  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  30.67 
 
 
591 aa  143  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  28.6 
 
 
501 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  25.97 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  25.4 
 
 
450 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  29.09 
 
 
518 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  28.02 
 
 
448 aa  103  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  24.71 
 
 
435 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.91 
 
 
518 aa  97.4  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  27.96 
 
 
580 aa  96.3  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 
570 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  27.25 
 
 
453 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.89 
 
 
565 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  25.17 
 
 
446 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.29 
 
 
565 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  26.1 
 
 
593 aa  88.6  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  26.78 
 
 
443 aa  88.2  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  31.5 
 
 
393 aa  86.7  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.06 
 
 
569 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  26.06 
 
 
609 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  25.78 
 
 
590 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  25.78 
 
 
590 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  26.67 
 
 
584 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  26.51 
 
 
609 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  26.18 
 
 
4332 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4723  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.06 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2452  AMP-dependent synthetase and ligase  23.53 
 
 
646 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  25.69 
 
 
4336 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  24.64 
 
 
556 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00356403  decreased coverage  0.0000000268145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  26.68 
 
 
466 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2417  non-ribosomal peptide synthetase, putative  31.75 
 
 
1772 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2354  putative acetyl-CoA synthetase  23.75 
 
 
511 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.804997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  27.39 
 
 
2137 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  26.64 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  21.4 
 
 
522 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  24.67 
 
 
3470 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  23.58 
 
 
4317 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  25.76 
 
 
4336 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  25.77 
 
 
798 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4680  coronafacic acid synthetase, ligase component  24.93 
 
 
509 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.128923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  22.86 
 
 
494 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  23.37 
 
 
4317 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  24.16 
 
 
5149 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  22.22 
 
 
531 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  24.5 
 
 
4991 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  24.06 
 
 
469 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0070  AMP-dependent synthetase and ligase  24 
 
 
717 aa  53.9  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  31.4 
 
 
2183 aa  53.5  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  24.25 
 
 
539 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0955  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  23.67 
 
 
1170 aa  53.5  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000517979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2685  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  25.28 
 
 
328 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  22.74 
 
 
998 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  24.41 
 
 
517 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1291  AMP-dependent synthetase and ligase  23.9 
 
 
551 aa  52.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4394  acyl-CoA synthetase  23.82 
 
 
423 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  22.67 
 
 
998 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3524  acyl-CoA synthetase  22.4 
 
 
433 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  24.47 
 
 
532 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  27.35 
 
 
403 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4073  amino acid adenylation domain protein  31.71 
 
 
1674 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  23.53 
 
 
554 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 
545 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143385  decreased coverage  0.00095166 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0838  AMP-dependent synthetase and ligase  21.9 
 
 
573 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4038  amino acid adenylation domain-containing protein  31.9 
 
 
1659 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>