More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2354 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2354  putative acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 511 aa  1038    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.804997 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5819  AMP-dependent synthetase and ligase  60.04 
 
 		 507 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28201  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1255  AMP-dependent synthetase and ligase  47.56 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1153  AMP-dependent synthetase and ligase  47.06 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2967  AMP-dependent synthetase and ligase  45.03 
 
 		 502 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.360291  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  46.65 
 
 		 512 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2517  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.28 
 
 		 513 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94794  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  32.41 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 508 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 519 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 520 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 527 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 518 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 490 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 505 aa  220  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 520 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  29.4 
 
 		 496 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  28.66 
 
 		 496 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 519 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  28.66 
 
 		 496 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.15 
 
 		 570 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.1 
 
 		 579 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 508 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 521 aa  212  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  28.87 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  31.98 
 
 		 533 aa  210  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 508 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 550 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 502 aa  207  4e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.48 
 
 		 526 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 520 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 544 aa  206  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 520 aa  206  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 521 aa  206  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 493 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 583 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  31.85 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 521 aa  204  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.79 
 
 		 503 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  30.65 
 
 		 545 aa  203  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 551 aa  203  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.46 
 
 		 525 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  33.8 
 
 		 565 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.77 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1913  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 515 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 		 519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.45 
 
 		 556 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  29.08 
 
 		 549 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.45 
 
 		 556 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.45 
 
 		 556 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  27.92 
 
 		 541 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.78 
 
 		 526 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 515 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 501 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  28.87 
 
 		 518 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  31.2 
 
 		 545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 577 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  30.89 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 527 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 528 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  29.92 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 		 525 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 514 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 533 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.41 
 
 		 491 aa  196  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 534 aa  196  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 		 519 aa  196  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.49 
 
 		 512 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 		 525 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.49 
 
 		 524 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 506 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.88 
 
 		 828 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.42 
 
 		 529 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.05 
 
 		 513 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 		 505 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  29.35 
 
 		 546 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 		 553 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2229  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 513 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0776358  hitchhiker  0.000000170623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 551 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 512 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  31.33 
 
 		 537 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  29.35 
 
 		 546 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  31.33 
 
 		 537 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>