More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5819 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5819  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
507 aa  996    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28201  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2354  putative acetyl-CoA synthetase  60.04 
 
 
511 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.804997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1153  AMP-dependent synthetase and ligase  48.19 
 
 
535 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1255  AMP-dependent synthetase and ligase  47.46 
 
 
506 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  47.69 
 
 
512 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120575  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2517  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.29 
 
 
513 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94794  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2967  AMP-dependent synthetase and ligase  45.98 
 
 
502 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.360291  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
505 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 
528 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
527 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 
518 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 
514 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  33.75 
 
 
525 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 
525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.12 
 
 
491 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.5 
 
 
519 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 
501 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 
520 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 
509 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 
559 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 
528 aa  210  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 
499 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 
490 aa  207  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 
520 aa  207  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 
521 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.25 
 
 
570 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.29 
 
 
527 aa  206  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 
521 aa  206  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
502 aa  206  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 
516 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.84 
 
 
556 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 
525 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.84 
 
 
556 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.84 
 
 
556 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 
508 aa  203  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 
524 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 
487 aa  203  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 
509 aa  202  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 
507 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 
520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  28.82 
 
 
544 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
518 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 
553 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 
517 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
517 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 
511 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.63 
 
 
503 aa  199  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 
501 aa  199  9e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.16 
 
 
579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 
511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 
520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 
508 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  30.88 
 
 
576 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
527 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 
509 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
525 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  30.08 
 
 
515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
521 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 
492 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
509 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 
519 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 
565 aa  196  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 
504 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 
493 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 
495 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  27.29 
 
 
549 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  30.3 
 
 
572 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 
527 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.88 
 
 
519 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 
523 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  36.76 
 
 
4575 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  27.29 
 
 
549 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.48 
 
 
554 aa  194  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
502 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 
512 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 
508 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  34.63 
 
 
4930 aa  193  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
501 aa  193  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 
505 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 
527 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  28.1 
 
 
549 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 
520 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 
532 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
514 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0115  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 
526 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 
519 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 
508 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 
583 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 
843 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 
511 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 
502 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1913  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 
515 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
561 aa  191  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  33.62 
 
 
507 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>