More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1153 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1153  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 535 aa  1094    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1255  AMP-dependent synthetase and ligase  90.51 
 
 		 506 aa  931    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  49.3 
 
 		 512 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2967  AMP-dependent synthetase and ligase  46.31 
 
 		 502 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.360291  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2354  putative acetyl-CoA synthetase  47.06 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.804997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2517  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.04 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94794  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5819  AMP-dependent synthetase and ligase  48.19 
 
 		 507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28201  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 520 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 525 aa  231  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.74 
 
 		 515 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.54 
 
 		 519 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 506 aa  216  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 		 520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 518 aa  210  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 505 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 492 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 511 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 511 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 5154 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 662 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  31.83 
 
 		 510 aa  204  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 519 aa  203  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 539 aa  203  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 		 490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.48 
 
 		 514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  32.86 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 516 aa  200  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.43 
 
 		 513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 522 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 508 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.72 
 
 		 514 aa  196  9e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 513 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 508 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.86 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 498 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  27.26 
 
 		 549 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.49 
 
 		 483 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.49 
 
 		 483 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 		 528 aa  193  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 510 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  33.1 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 508 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.44 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 583 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  33.27 
 
 		 6768 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  30.79 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  31.54 
 
 		 531 aa  192  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 515 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 517 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 518 aa  190  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 527 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  27.4 
 
 		 549 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  29.9 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.91 
 
 		 483 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  32.97 
 
 		 4930 aa  188  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 511 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.51 
 
 		 530 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  30.32 
 
 		 504 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.46 
 
 		 512 aa  187  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  27.79 
 
 		 496 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  27.79 
 
 		 496 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 519 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 518 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 518 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  32.94 
 
 		 4575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  32.08 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  27.22 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1359  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.96 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.76 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 561 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 500 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  27.79 
 
 		 496 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.44 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.76 
 
 		 510 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  27.82 
 
 		 564 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 520 aa  184  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.23 
 
 		 503 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.76 
 
 		 510 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.76 
 
 		 510 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.76 
 
 		 510 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 524 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>