More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1291 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0035  AMP-dependent synthetase and ligase  56.81 
 
 		 571 aa  681    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284742  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1291  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 551 aa  1110    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  36.63 
 
 		 632 aa  362  1e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  35.54 
 
 		 626 aa  347  3e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  34.41 
 
 		 656 aa  343  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  36.29 
 
 		 629 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  36.91 
 
 		 631 aa  341  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  34.47 
 
 		 648 aa  340  4e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  34.09 
 
 		 667 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1386  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 626 aa  336  7.999999999999999e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.911526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  36.5 
 
 		 635 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  35.18 
 
 		 625 aa  333  4e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  34.15 
 
 		 657 aa  333  4e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  36.03 
 
 		 629 aa  333  5e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  34.15 
 
 		 667 aa  333  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 636 aa  332  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  34.36 
 
 		 664 aa  332  9e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  34.89 
 
 		 649 aa  331  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 633 aa  331  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  35.06 
 
 		 638 aa  330  4e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 652 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  33.93 
 
 		 667 aa  326  5e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2894  acetate/CoA ligase  33.76 
 
 		 631 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  33.11 
 
 		 638 aa  324  2e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  34.79 
 
 		 632 aa  323  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 666 aa  323  6e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 627 aa  323  6e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  35.07 
 
 		 632 aa  323  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  34.55 
 
 		 653 aa  322  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1711  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 653 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.103973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  34.41 
 
 		 656 aa  320  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  35.87 
 
 		 629 aa  319  6e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  33.93 
 
 		 655 aa  319  9e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  34.04 
 
 		 652 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  34.52 
 
 		 661 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 650 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  33.44 
 
 		 663 aa  317  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  35.07 
 
 		 629 aa  316  6e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  34.76 
 
 		 648 aa  316  7e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 661 aa  316  7e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  35.44 
 
 		 631 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  32.31 
 
 		 651 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  32.15 
 
 		 663 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0917  acetate/CoA ligase  33.6 
 
 		 637 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  34.85 
 
 		 651 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3375  acetyl-CoA synthetase  32.2 
 
 		 653 aa  312  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  31.99 
 
 		 652 aa  312  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 648 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  33.17 
 
 		 666 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 666 aa  312  1e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  33.23 
 
 		 666 aa  311  2e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  33.17 
 
 		 660 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  33.17 
 
 		 660 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  34.17 
 
 		 639 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  34.88 
 
 		 643 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  34.09 
 
 		 649 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  31.44 
 
 		 651 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  33.76 
 
 		 660 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  32.37 
 
 		 636 aa  310  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  32.3 
 
 		 656 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  33.55 
 
 		 667 aa  309  6.999999999999999e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  31.66 
 
 		 652 aa  309  9e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3517  acetate/CoA ligase  33.33 
 
 		 632 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  31.66 
 
 		 652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1750  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0604135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  31.99 
 
 		 654 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4994  acetate/CoA ligase  33.12 
 
 		 629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596864  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0250  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3260  acetyl-CoA synthetase  31.83 
 
 		 653 aa  307  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  33.11 
 
 		 644 aa  307  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  33.17 
 
 		 636 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  33.67 
 
 		 639 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  32.85 
 
 		 655 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  32.78 
 
 		 649 aa  306  6e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  33.07 
 
 		 657 aa  306  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 663 aa  306  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  33.28 
 
 		 645 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03255  acetyl-CoA synthetase  33.01 
 
 		 635 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0420  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 629 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0761365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  32.64 
 
 		 631 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5598  acetyl-CoA synthetase  32.36 
 
 		 648 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  31.72 
 
 		 652 aa  304  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  33.23 
 
 		 658 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  32.31 
 
 		 650 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  32.96 
 
 		 664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34530  acetyl-CoA synthetase  32.26 
 
 		 653 aa  304  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  33.93 
 
 		 661 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  33.01 
 
 		 666 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  33.61 
 
 		 649 aa  303  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  33.44 
 
 		 655 aa  303  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  33.28 
 
 		 645 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3992  acetyl-CoA synthetase  31.55 
 
 		 653 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733733  normal  0.105895 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  31.9 
 
 		 651 aa  302  8.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  33.33 
 
 		 636 aa  303  8.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  33.01 
 
 		 660 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  32.64 
 
 		 664 aa  302  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  33.39 
 
 		 661 aa  302  9e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  32.77 
 
 		 659 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  32.8 
 
 		 661 aa  302  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2042  acetate/CoA ligase  32.8 
 
 		 636 aa  302  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155231  normal  0.184669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>