More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1386 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0420  AMP-dependent synthetase and ligase  81.21 
 
 		 629 aa  1042    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0761365 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1386  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 626 aa  1278    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.911526 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0250  AMP-dependent synthetase and ligase  80.89 
 
 		 629 aa  1040    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  48.34 
 
 		 667 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  47.32 
 
 		 666 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  47.14 
 
 		 638 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  46.58 
 
 		 639 aa  568  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  46.5 
 
 		 639 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  47.48 
 
 		 668 aa  554  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  47.79 
 
 		 670 aa  552  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  46.3 
 
 		 666 aa  548  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  43.47 
 
 		 656 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  45.67 
 
 		 666 aa  546  1e-154  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  44.71 
 
 		 652 aa  545  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  44.71 
 
 		 664 aa  541  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  46.18 
 
 		 648 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  45.26 
 
 		 692 aa  540  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  43.91 
 
 		 652 aa  537  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  44.77 
 
 		 650 aa  531  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  46.42 
 
 		 651 aa  533  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  43.43 
 
 		 652 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  44.61 
 
 		 632 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  43.83 
 
 		 631 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  44.61 
 
 		 632 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  44.44 
 
 		 631 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  44.7 
 
 		 650 aa  528  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  44.6 
 
 		 633 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  44.64 
 
 		 663 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  44.66 
 
 		 659 aa  522  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  45.79 
 
 		 670 aa  523  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  44.98 
 
 		 660 aa  524  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  45.01 
 
 		 656 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  42.88 
 
 		 664 aa  521  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  45.12 
 
 		 655 aa  521  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  45.25 
 
 		 643 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  46.73 
 
 		 653 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  42.99 
 
 		 652 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  44.81 
 
 		 644 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  43.83 
 
 		 625 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  45.37 
 
 		 659 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  43.41 
 
 		 655 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  44.98 
 
 		 632 aa  513  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  42.13 
 
 		 666 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  44.01 
 
 		 629 aa  510  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  42.41 
 
 		 638 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  44.57 
 
 		 631 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  43.29 
 
 		 663 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  43.75 
 
 		 649 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  43.69 
 
 		 629 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  44.01 
 
 		 629 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  45.27 
 
 		 656 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  43.84 
 
 		 649 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  45.43 
 
 		 659 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  45.91 
 
 		 661 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  43.6 
 
 		 660 aa  502  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  43.15 
 
 		 656 aa  502  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  43.91 
 
 		 649 aa  504  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  44.37 
 
 		 658 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  43.29 
 
 		 652 aa  503  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  44.32 
 
 		 655 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  43.06 
 
 		 661 aa  502  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  42.99 
 
 		 657 aa  504  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  43.12 
 
 		 661 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  41.47 
 
 		 667 aa  499  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  44.28 
 
 		 631 aa  501  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  44.83 
 
 		 674 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  43.97 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  42.11 
 
 		 657 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  42.74 
 
 		 667 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  41.31 
 
 		 657 aa  499  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  44.08 
 
 		 629 aa  499  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  42.31 
 
 		 649 aa  501  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  42.5 
 
 		 715 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  42.16 
 
 		 636 aa  501  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  42.95 
 
 		 632 aa  499  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  41.73 
 
 		 653 aa  497  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  41.52 
 
 		 636 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  43.73 
 
 		 660 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  43.68 
 
 		 649 aa  497  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  43.29 
 
 		 655 aa  495  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  41.31 
 
 		 667 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  43.15 
 
 		 657 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  43.26 
 
 		 660 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  43.17 
 
 		 660 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  43.88 
 
 		 646 aa  494  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  41.02 
 
 		 636 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  44.25 
 
 		 670 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  43.99 
 
 		 667 aa  490  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  43.59 
 
 		 656 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  41.04 
 
 		 652 aa  490  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  41.36 
 
 		 655 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  43.02 
 
 		 632 aa  489  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  41.01 
 
 		 648 aa  491  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  41.36 
 
 		 655 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0318  acetate/CoA ligase  44.23 
 
 		 665 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  43.29 
 
 		 654 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  41.78 
 
 		 653 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  41.71 
 
 		 656 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  43.06 
 
 		 661 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  42.14 
 
 		 664 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>