More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0250 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1386  AMP-dependent synthetase and ligase  80.89 
 
 
626 aa  1073    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.911526 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0250  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
629 aa  1290    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0420  AMP-dependent synthetase and ligase  97.93 
 
 
629 aa  1227    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0761365 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
638 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  50.24 
 
 
667 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
666 aa  597  1e-169  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
668 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  47.56 
 
 
639 aa  571  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  47.56 
 
 
639 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  49.53 
 
 
670 aa  570  1e-161  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  48.87 
 
 
670 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  45.8 
 
 
656 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  46.96 
 
 
652 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  46.15 
 
 
652 aa  552  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  45.53 
 
 
664 aa  552  1e-156  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  46.87 
 
 
666 aa  552  1e-156  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  47.25 
 
 
666 aa  551  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  46.24 
 
 
632 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  46.24 
 
 
632 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  46.66 
 
 
631 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  45.83 
 
 
652 aa  551  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  46.14 
 
 
652 aa  547  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  46.24 
 
 
631 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  47.69 
 
 
659 aa  547  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  46.98 
 
 
648 aa  546  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  47.96 
 
 
656 aa  540  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  46.42 
 
 
650 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  47.01 
 
 
660 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  47.46 
 
 
651 aa  541  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  45.31 
 
 
692 aa  534  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  46.82 
 
 
653 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  46.9 
 
 
643 aa  534  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  45.63 
 
 
650 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  47.08 
 
 
632 aa  529  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  46.3 
 
 
659 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  44.87 
 
 
633 aa  531  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  45.99 
 
 
655 aa  529  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  45.44 
 
 
661 aa  531  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  44.72 
 
 
656 aa  527  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  45.18 
 
 
680 aa  522  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  45.98 
 
 
629 aa  522  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  45.72 
 
 
629 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  45.77 
 
 
652 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  44.5 
 
 
655 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  43.49 
 
 
636 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  44.5 
 
 
655 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  44.36 
 
 
663 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  46.33 
 
 
661 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  45.19 
 
 
653 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  43.01 
 
 
636 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  45.6 
 
 
649 aa  519  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  44.25 
 
 
661 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  43.85 
 
 
715 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  43.36 
 
 
655 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  45.38 
 
 
644 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  45.21 
 
 
657 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  43.62 
 
 
638 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  46.62 
 
 
655 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  42.43 
 
 
636 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  44.11 
 
 
667 aa  513  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  44.2 
 
 
666 aa  515  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  43.86 
 
 
649 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  44.28 
 
 
629 aa  513  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  45.71 
 
 
659 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  45.27 
 
 
658 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  43.29 
 
 
664 aa  512  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  44.3 
 
 
646 aa  514  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  44.52 
 
 
632 aa  511  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  44.87 
 
 
660 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  44.18 
 
 
656 aa  510  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  44.73 
 
 
649 aa  512  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  43.63 
 
 
657 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  44.65 
 
 
656 aa  510  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  45.17 
 
 
674 aa  508  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  43.94 
 
 
652 aa  510  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  43.53 
 
 
657 aa  510  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  44.29 
 
 
654 aa  507  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  44.99 
 
 
663 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  44.57 
 
 
656 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  43.85 
 
 
625 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  45.04 
 
 
667 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  45.56 
 
 
631 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  42.12 
 
 
649 aa  504  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  44.69 
 
 
649 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  44.95 
 
 
655 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  43.95 
 
 
667 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  44.91 
 
 
632 aa  502  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  43.01 
 
 
657 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  43.71 
 
 
653 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  45.45 
 
 
631 aa  499  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  44.08 
 
 
629 aa  499  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  43.49 
 
 
660 aa  502  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  44.82 
 
 
665 aa  501  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  43.55 
 
 
660 aa  498  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  43.35 
 
 
661 aa  496  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  43.4 
 
 
660 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  43.47 
 
 
667 aa  497  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  43.87 
 
 
660 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  44.99 
 
 
664 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  44.52 
 
 
661 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>