More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0420 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1386  AMP-dependent synthetase and ligase  81.21 
 
 
626 aa  1077    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.911526 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0420  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
629 aa  1287    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0761365 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0250  AMP-dependent synthetase and ligase  97.93 
 
 
629 aa  1228    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  49.84 
 
 
638 aa  600  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
667 aa  600  1e-170  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  49.84 
 
 
666 aa  594  1e-168  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  47.56 
 
 
639 aa  572  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
668 aa  571  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  47.56 
 
 
639 aa  571  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  49.37 
 
 
670 aa  568  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  48.87 
 
 
670 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  45.48 
 
 
656 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  46.47 
 
 
652 aa  555  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  46.07 
 
 
664 aa  555  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  48.04 
 
 
666 aa  555  1e-156  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  46.95 
 
 
666 aa  552  1e-156  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  46.49 
 
 
631 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  45.84 
 
 
652 aa  545  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  45.67 
 
 
652 aa  548  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  45.31 
 
 
632 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  45.35 
 
 
652 aa  547  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  46.98 
 
 
648 aa  546  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  45.31 
 
 
632 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  45.31 
 
 
631 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  47.75 
 
 
659 aa  546  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  45.93 
 
 
650 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  48.12 
 
 
656 aa  541  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  46.98 
 
 
651 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  46.69 
 
 
660 aa  536  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  46.73 
 
 
643 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  45.5 
 
 
633 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  45.47 
 
 
650 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  45.47 
 
 
692 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  45.97 
 
 
659 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  46.58 
 
 
653 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  45.13 
 
 
661 aa  528  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  46.15 
 
 
655 aa  528  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  46.44 
 
 
632 aa  525  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  44.41 
 
 
656 aa  521  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  45.56 
 
 
629 aa  521  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  44.5 
 
 
655 aa  522  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  45.82 
 
 
629 aa  521  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  45.14 
 
 
652 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  44.5 
 
 
655 aa  522  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  44.08 
 
 
661 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  43.17 
 
 
636 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  44.84 
 
 
653 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  43.68 
 
 
715 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  46.01 
 
 
661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  45.24 
 
 
649 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  45.06 
 
 
644 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  44.2 
 
 
666 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  42.7 
 
 
636 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  46.62 
 
 
655 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  44.79 
 
 
680 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  43.3 
 
 
638 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  43.29 
 
 
664 aa  512  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  43.11 
 
 
655 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  45.21 
 
 
657 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  44.11 
 
 
667 aa  513  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  43.89 
 
 
663 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  44.89 
 
 
649 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  42.11 
 
 
636 aa  510  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  43.63 
 
 
649 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  43.8 
 
 
629 aa  512  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  44.5 
 
 
656 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  43.63 
 
 
657 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  44.52 
 
 
632 aa  510  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  44.23 
 
 
646 aa  508  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  43.8 
 
 
656 aa  508  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  45.4 
 
 
659 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  43.74 
 
 
652 aa  508  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  43.31 
 
 
657 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  43.95 
 
 
667 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  44.64 
 
 
658 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  44.39 
 
 
660 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  43.53 
 
 
625 aa  504  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  45.4 
 
 
631 aa  505  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  44.67 
 
 
663 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  43.9 
 
 
654 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  44.79 
 
 
667 aa  500  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  43.17 
 
 
657 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  45.12 
 
 
674 aa  501  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  44.79 
 
 
655 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  44.75 
 
 
632 aa  500  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  44.34 
 
 
656 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  44.37 
 
 
649 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  43.4 
 
 
660 aa  497  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  45.06 
 
 
651 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  43.47 
 
 
667 aa  498  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  43.83 
 
 
661 aa  497  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  43.55 
 
 
653 aa  498  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  44.18 
 
 
665 aa  496  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  42.03 
 
 
649 aa  498  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  43.92 
 
 
629 aa  498  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  43.17 
 
 
660 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  45.13 
 
 
631 aa  498  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  44.52 
 
 
661 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  44.52 
 
 
656 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  45.01 
 
 
664 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>