More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03255 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  54.92 
 
 		 647 aa  704    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  52.15 
 
 		 652 aa  671    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  51.99 
 
 		 652 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  50.32 
 
 		 650 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  55.11 
 
 		 653 aa  689    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  55.59 
 
 		 644 aa  722    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  55.95 
 
 		 662 aa  731    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  72.11 
 
 		 636 aa  994    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  55.87 
 
 		 648 aa  734    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  53.83 
 
 		 651 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  54.14 
 
 		 651 aa  694    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  50.16 
 
 		 650 aa  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  55.11 
 
 		 651 aa  688    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  55.11 
 
 		 653 aa  689    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  51.88 
 
 		 652 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  50.32 
 
 		 650 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  50.79 
 
 		 650 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  54.95 
 
 		 651 aa  685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  49.84 
 
 		 658 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  56.39 
 
 		 645 aa  730    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  55.06 
 
 		 653 aa  716    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  50.32 
 
 		 658 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0624  acetyl-CoA synthetase  51.18 
 
 		 651 aa  664    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3006  acetate--CoA ligase  52.22 
 
 		 652 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.972893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  52.72 
 
 		 652 aa  693    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  51.65 
 
 		 657 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  55.08 
 
 		 651 aa  698    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  50.32 
 
 		 650 aa  651    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  55.11 
 
 		 651 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  54.15 
 
 		 645 aa  710    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  55.06 
 
 		 653 aa  715    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1863  acetyl-CoA synthetase  51.11 
 
 		 650 aa  648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.579141  normal  0.108064 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.96 
 
 		 667 aa  646    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  52.97 
 
 		 651 aa  681    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.2 
 
 		 666 aa  653    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  55.34 
 
 		 651 aa  698    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.29 
 
 		 661 aa  704    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  54.86 
 
 		 649 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  51.27 
 
 		 651 aa  636    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01635  acetyl-CoA synthase  49.53 
 
 		 653 aa  652    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 		 652 aa  683    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  56.98 
 
 		 646 aa  720    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  53.78 
 
 		 644 aa  707    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00169  acetyl-CoA synthetase  52.24 
 
 		 682 aa  673    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  53.85 
 
 		 652 aa  703    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  54.18 
 
 		 649 aa  706    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  55.41 
 
 		 649 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  52.67 
 
 		 652 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  55.01 
 
 		 645 aa  707    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  54.94 
 
 		 654 aa  721    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  54.79 
 
 		 645 aa  723    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  53.69 
 
 		 647 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1399  acetate--CoA ligase  55.05 
 
 		 653 aa  707    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570682  normal  0.412853 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  52.15 
 
 		 652 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0297  acetyl-CoA synthetase  53.4 
 
 		 652 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.447688  hitchhiker  0.000249841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  54.55 
 
 		 650 aa  695    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 		 651 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  55.59 
 
 		 644 aa  723    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  52.4 
 
 		 649 aa  677    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  54.01 
 
 		 650 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  53.75 
 
 		 649 aa  681    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  52.72 
 
 		 652 aa  691    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  50.95 
 
 		 655 aa  650    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  54.3 
 
 		 651 aa  696    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  51.51 
 
 		 652 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3553  acetyl-coenzyme A synthetase  55.05 
 
 		 658 aa  710    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  56.57 
 
 		 652 aa  712    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  53.17 
 
 		 654 aa  689    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  52.79 
 
 		 652 aa  679    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2558  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 		 650 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  53.59 
 
 		 652 aa  687    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  52.84 
 
 		 644 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  51.67 
 
 		 646 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  54.62 
 
 		 654 aa  702    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  60.06 
 
 		 631 aa  816    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  51.34 
 
 		 655 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  50.32 
 
 		 650 aa  658    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  50.32 
 
 		 650 aa  658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  56.98 
 
 		 645 aa  749    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 		 650 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  53.77 
 
 		 651 aa  672    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  51.59 
 
 		 650 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  50.16 
 
 		 656 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  53.67 
 
 		 651 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  56.07 
 
 		 645 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  52.15 
 
 		 652 aa  672    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  54.63 
 
 		 653 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  54.65 
 
 		 661 aa  712    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  57.37 
 
 		 650 aa  740    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  56.23 
 
 		 645 aa  735    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  55.22 
 
 		 644 aa  734    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  50.48 
 
 		 650 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  50.64 
 
 		 658 aa  643    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  51.67 
 
 		 667 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  54.14 
 
 		 651 aa  707    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  54.14 
 
 		 651 aa  707    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  54.9 
 
 		 653 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  54.88 
 
 		 645 aa  732    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  50.95 
 
 		 650 aa  658    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  53.13 
 
 		 645 aa  695    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>