More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2047 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  54.03 
 
 
627 aa  687    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  88.65 
 
 
650 aa  1206    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 
651 aa  1332    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  53.43 
 
 
632 aa  658    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  53.57 
 
 
629 aa  681    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  52.6 
 
 
629 aa  655    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  53.15 
 
 
629 aa  648    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  52.57 
 
 
629 aa  646    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  54.76 
 
 
636 aa  706    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  52.03 
 
 
631 aa  655    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  54.37 
 
 
632 aa  677    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  53.36 
 
 
635 aa  656    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  53.17 
 
 
632 aa  634  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 
626 aa  631  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  51.7 
 
 
631 aa  630  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  46.2 
 
 
652 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  48.58 
 
 
625 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  47.25 
 
 
643 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  48.59 
 
 
648 aa  596  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  47.95 
 
 
649 aa  594  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  49.22 
 
 
661 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1587  transcriptional regulator, IclR family  52.95 
 
 
835 aa  587  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0088004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  47.63 
 
 
639 aa  585  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  49.08 
 
 
639 aa  579  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  45.18 
 
 
652 aa  576  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  47.98 
 
 
656 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  46.44 
 
 
656 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  46.3 
 
 
656 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  45.6 
 
 
660 aa  569  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  45.9 
 
 
664 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  46.82 
 
 
657 aa  569  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  47.35 
 
 
661 aa  571  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  45.75 
 
 
664 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  47.33 
 
 
632 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  46.44 
 
 
655 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  48.6 
 
 
661 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  47.17 
 
 
632 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  47.33 
 
 
631 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  46.11 
 
 
667 aa  568  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  46.3 
 
 
656 aa  567  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  45.67 
 
 
657 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  46.68 
 
 
655 aa  564  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  46.04 
 
 
670 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  47.23 
 
 
663 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  47.03 
 
 
636 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  46.08 
 
 
657 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  46.37 
 
 
636 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  46.93 
 
 
631 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  45.81 
 
 
656 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  46.44 
 
 
655 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  45.84 
 
 
655 aa  556  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  46.44 
 
 
655 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  45.55 
 
 
659 aa  557  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  44.55 
 
 
660 aa  555  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  46.42 
 
 
655 aa  554  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  45.61 
 
 
649 aa  554  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  46.12 
 
 
666 aa  552  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  44.69 
 
 
649 aa  555  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  45.31 
 
 
651 aa  551  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  42.55 
 
 
657 aa  550  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  46.82 
 
 
667 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  42.86 
 
 
664 aa  550  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  45.77 
 
 
650 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  45.3 
 
 
650 aa  549  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  43.37 
 
 
667 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  46.14 
 
 
661 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  49.42 
 
 
659 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  45.87 
 
 
636 aa  551  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  45.52 
 
 
715 aa  548  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  45.08 
 
 
658 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  46.72 
 
 
661 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  47.29 
 
 
656 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  45.95 
 
 
654 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  43.39 
 
 
653 aa  545  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  44.88 
 
 
660 aa  548  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  44.28 
 
 
638 aa  545  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  46.73 
 
 
667 aa  547  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  44.44 
 
 
657 aa  545  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  42.49 
 
 
666 aa  545  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  43.67 
 
 
652 aa  545  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  44.67 
 
 
649 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  45.89 
 
 
657 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  43.78 
 
 
652 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  46.89 
 
 
661 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  45.13 
 
 
680 aa  540  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  43.17 
 
 
652 aa  542  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  41.99 
 
 
667 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  44.58 
 
 
658 aa  538  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  45.44 
 
 
650 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  45.79 
 
 
670 aa  538  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  45.44 
 
 
649 aa  537  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  44.07 
 
 
658 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  47.28 
 
 
656 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  47.61 
 
 
644 aa  536  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  45.77 
 
 
656 aa  536  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  46.9 
 
 
661 aa  537  1e-151  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  43.6 
 
 
650 aa  532  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  43.88 
 
 
654 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  43.57 
 
 
663 aa  532  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  44.3 
 
 
653 aa  534  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>