More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0035 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0035  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
571 aa  1160    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284742  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1291  AMP-dependent synthetase and ligase  56.81 
 
 
551 aa  667    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1386  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 
626 aa  360  5e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.911526 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  36.99 
 
 
632 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  34.89 
 
 
667 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  31.99 
 
 
656 aa  340  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  35.43 
 
 
657 aa  337  5e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
627 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  34.79 
 
 
648 aa  332  8e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  35.16 
 
 
664 aa  332  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
652 aa  331  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  34.72 
 
 
667 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  33.66 
 
 
636 aa  329  8e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  34.25 
 
 
666 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  33.11 
 
 
638 aa  327  3e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 
661 aa  326  8.000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  33.01 
 
 
636 aa  326  9e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  33.01 
 
 
636 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 
649 aa  324  2e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.738373 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  34.78 
 
 
667 aa  324  3e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  33.6 
 
 
649 aa  324  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  34.15 
 
 
655 aa  324  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  33.75 
 
 
667 aa  324  3e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  34.65 
 
 
626 aa  323  4e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  34.72 
 
 
631 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  33.17 
 
 
651 aa  322  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  33.18 
 
 
666 aa  321  3e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  33.44 
 
 
638 aa  321  3e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0420  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 
629 aa  320  3e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0761365 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  33.12 
 
 
666 aa  320  5e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  33.88 
 
 
632 aa  318  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0250  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 
629 aa  318  2e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  33.94 
 
 
629 aa  316  6e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  34.09 
 
 
663 aa  316  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  34.4 
 
 
635 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  33.66 
 
 
629 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3517  acetate/CoA ligase  32.64 
 
 
632 aa  313  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2042  acetate/CoA ligase  33.49 
 
 
636 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155231  normal  0.184669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2894  acetate/CoA ligase  33.01 
 
 
631 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  33.67 
 
 
643 aa  312  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  32.26 
 
 
649 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  33.22 
 
 
629 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  32.47 
 
 
652 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 
633 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  33.65 
 
 
636 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  33.56 
 
 
632 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  33.39 
 
 
670 aa  310  4e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0917  acetate/CoA ligase  33.44 
 
 
637 aa  310  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 
636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
668 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  31.97 
 
 
661 aa  307  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  34.05 
 
 
631 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  32.04 
 
 
649 aa  306  7e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  32.27 
 
 
660 aa  306  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  33.81 
 
 
656 aa  306  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1711  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 
653 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.103973  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  33.72 
 
 
660 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  31.27 
 
 
715 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1386  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 
654 aa  303  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  32.68 
 
 
632 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  33.33 
 
 
670 aa  303  7.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  33.01 
 
 
655 aa  302  9e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  34.85 
 
 
629 aa  302  1e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 
880 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  32.52 
 
 
632 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  33.5 
 
 
631 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1587  transcriptional regulator, IclR family  34.21 
 
 
835 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0088004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  33.33 
 
 
666 aa  301  3e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  33.55 
 
 
655 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  34.21 
 
 
659 aa  301  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  32.52 
 
 
631 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  33.73 
 
 
659 aa  299  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  33.17 
 
 
654 aa  299  8e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  33.55 
 
 
657 aa  299  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  33.55 
 
 
657 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  30.76 
 
 
661 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 
631 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000235453  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  31.89 
 
 
657 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  32.64 
 
 
655 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  32.57 
 
 
631 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  32.79 
 
 
646 aa  297  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4994  acetate/CoA ligase  32.26 
 
 
629 aa  297  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596864  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  33.12 
 
 
670 aa  297  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  33.28 
 
 
649 aa  296  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  32.85 
 
 
660 aa  296  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  34.26 
 
 
651 aa  296  6e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1176  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 
631 aa  296  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1288  propionate--CoA ligase  31.25 
 
 
631 aa  296  8e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1641  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 
656 aa  296  9e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  32.28 
 
 
639 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  31.27 
 
 
625 aa  295  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1451  acetyl-CoA synthetase  32.43 
 
 
647 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0872  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 
640 aa  296  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 
637 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.313288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  32.96 
 
 
664 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  33.23 
 
 
664 aa  295  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03255  acetyl-CoA synthetase  32.8 
 
 
635 aa  294  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  32.45 
 
 
650 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  32.38 
 
 
648 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  32.4 
 
 
659 aa  295  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>