More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1711 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1750  AMP-dependent synthetase and ligase  59 
 
 		 636 aa  749    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0604135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1711  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 653 aa  1319    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.103973  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1641  AMP-dependent synthetase and ligase  54.69 
 
 		 656 aa  674    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2769  putative acetyl-CoA synthetase and ligase  50.25 
 
 		 650 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914995  normal  0.208075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  46.06 
 
 		 652 aa  594  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  46.42 
 
 		 648 aa  580  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  45.41 
 
 		 643 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  44.98 
 
 		 652 aa  577  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  46.37 
 
 		 638 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  46.67 
 
 		 656 aa  566  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  46.28 
 
 		 657 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  45.96 
 
 		 655 aa  567  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  45.27 
 
 		 656 aa  567  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  44.9 
 
 		 649 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  42.2 
 
 		 657 aa  560  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  43.96 
 
 		 664 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  45.61 
 
 		 656 aa  557  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  43.67 
 
 		 664 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  44.81 
 
 		 655 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  42.36 
 
 		 667 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  45.51 
 
 		 657 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  42.04 
 
 		 664 aa  550  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  42.52 
 
 		 667 aa  551  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  42.2 
 
 		 666 aa  550  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  43.53 
 
 		 649 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  42.68 
 
 		 667 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  46.75 
 
 		 667 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  45.13 
 
 		 651 aa  542  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  45.18 
 
 		 661 aa  543  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  44.91 
 
 		 660 aa  542  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  45.4 
 
 		 639 aa  542  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  45.94 
 
 		 661 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  45.17 
 
 		 661 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  44.72 
 
 		 631 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  45.78 
 
 		 658 aa  538  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  44.67 
 
 		 639 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  43.29 
 
 		 631 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  45.11 
 
 		 667 aa  538  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  44.39 
 
 		 632 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  43.08 
 
 		 655 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  44.22 
 
 		 632 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  43.08 
 
 		 655 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  44.73 
 
 		 666 aa  535  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  42.9 
 
 		 660 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  42.39 
 
 		 649 aa  529  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  41.8 
 
 		 658 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  42.2 
 
 		 663 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  41.94 
 
 		 649 aa  531  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  43.83 
 
 		 632 aa  527  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  42.88 
 
 		 657 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  44.96 
 
 		 668 aa  526  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  41.64 
 
 		 658 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  45.11 
 
 		 654 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  45.44 
 
 		 670 aa  523  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  43.96 
 
 		 658 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  43.01 
 
 		 657 aa  525  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  41.15 
 
 		 648 aa  520  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  41.49 
 
 		 653 aa  519  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  42.81 
 
 		 629 aa  519  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  42.06 
 
 		 645 aa  519  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  41.69 
 
 		 636 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  41.17 
 
 		 664 aa  518  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  44.27 
 
 		 629 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  41.69 
 
 		 636 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  43.25 
 
 		 666 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  42.18 
 
 		 652 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  41.69 
 
 		 636 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  43.61 
 
 		 632 aa  514  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  42.33 
 
 		 652 aa  514  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  42.17 
 
 		 651 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  42.7 
 
 		 650 aa  513  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  40.15 
 
 		 660 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  43.02 
 
 		 655 aa  512  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  41.49 
 
 		 645 aa  512  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  42.17 
 
 		 651 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  41.64 
 
 		 658 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  42.44 
 
 		 666 aa  510  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  42.02 
 
 		 652 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  43.66 
 
 		 650 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  41.98 
 
 		 638 aa  511  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  42.79 
 
 		 652 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  41.64 
 
 		 660 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  43.93 
 
 		 680 aa  506  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  41.44 
 
 		 648 aa  507  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  42.81 
 
 		 655 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  41.49 
 
 		 660 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  41.18 
 
 		 660 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2952  acetyl-CoA synthetase  42.88 
 
 		 649 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  42.72 
 
 		 656 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  40.8 
 
 		 644 aa  508  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  43.69 
 
 		 658 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  43.01 
 
 		 673 aa  504  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0111  acetyl-CoA synthetase  43.32 
 
 		 646 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4621  acetyl-CoA synthetase  42.46 
 
 		 652 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4619  acetyl-CoA synthetase  42.46 
 
 		 652 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.341691  normal  0.539786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  42.95 
 
 		 650 aa  505  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  42.08 
 
 		 651 aa  505  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  42.08 
 
 		 651 aa  505  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4535  acetyl-CoA synthetase  42.46 
 
 		 652 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  43.85 
 
 		 715 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>