More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1641 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1750  AMP-dependent synthetase and ligase  55.43 
 
 		 636 aa  654    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0604135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1711  AMP-dependent synthetase and ligase  54.69 
 
 		 653 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.103973  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1641  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 656 aa  1317    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2769  putative acetyl-CoA synthetase and ligase  48.48 
 
 		 650 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914995  normal  0.208075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  43.79 
 
 		 661 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  43.2 
 
 		 666 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  42.26 
 
 		 667 aa  508  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  44.25 
 
 		 670 aa  504  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  44.53 
 
 		 658 aa  501  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  42.79 
 
 		 649 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  41.85 
 
 		 652 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  41.89 
 
 		 667 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  41.44 
 
 		 667 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  41.6 
 
 		 657 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  41.44 
 
 		 664 aa  493  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  43.43 
 
 		 656 aa  494  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  42.81 
 
 		 638 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  41.6 
 
 		 655 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  41.1 
 
 		 666 aa  492  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  41.15 
 
 		 636 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  41.6 
 
 		 655 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  44.09 
 
 		 656 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  41.04 
 
 		 648 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  41.15 
 
 		 636 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  40.83 
 
 		 636 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  42 
 
 		 649 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  41.63 
 
 		 650 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  42.86 
 
 		 663 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  43.68 
 
 		 657 aa  488  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  39.78 
 
 		 652 aa  482  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  42.62 
 
 		 661 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  43.68 
 
 		 668 aa  483  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  44.62 
 
 		 661 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  45.02 
 
 		 654 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  43.76 
 
 		 653 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  42.11 
 
 		 654 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  41.15 
 
 		 666 aa  480  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  42.27 
 
 		 667 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  41.04 
 
 		 667 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  42.37 
 
 		 660 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  42.83 
 
 		 715 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  40.03 
 
 		 649 aa  478  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  40.82 
 
 		 658 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  43.4 
 
 		 661 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  43.49 
 
 		 660 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  41.45 
 
 		 656 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  40.43 
 
 		 655 aa  472  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  40.09 
 
 		 655 aa  472  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  40.44 
 
 		 649 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  41.1 
 
 		 663 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1868  acetate/CoA ligase  41.92 
 
 		 652 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.477544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  39.76 
 
 		 657 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  40.46 
 
 		 673 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  40.61 
 
 		 653 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  43 
 
 		 651 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  41.23 
 
 		 660 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  41.75 
 
 		 643 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  41.23 
 
 		 660 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  41.27 
 
 		 666 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  40.31 
 
 		 657 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  41.64 
 
 		 661 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  41.94 
 
 		 655 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  44.43 
 
 		 674 aa  468  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  40.39 
 
 		 656 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  43.93 
 
 		 651 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  45.22 
 
 		 667 aa  468  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  43.06 
 
 		 656 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  39.25 
 
 		 664 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  40.79 
 
 		 655 aa  465  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  42.16 
 
 		 665 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  38.63 
 
 		 656 aa  464  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  40.29 
 
 		 654 aa  462  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  39.4 
 
 		 664 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  38.3 
 
 		 658 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  42.39 
 
 		 649 aa  465  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  39.88 
 
 		 631 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  39.2 
 
 		 658 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  39.04 
 
 		 658 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  40.52 
 
 		 657 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  37.44 
 
 		 660 aa  462  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  43.08 
 
 		 658 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  42.1 
 
 		 644 aa  462  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  39.7 
 
 		 660 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  40.52 
 
 		 654 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  40.68 
 
 		 651 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  40.34 
 
 		 654 aa  458  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  44.18 
 
 		 680 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  39.39 
 
 		 657 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  41.91 
 
 		 667 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  39.39 
 
 		 660 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  42.6 
 
 		 670 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  39.09 
 
 		 660 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  42.95 
 
 		 655 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  40.16 
 
 		 639 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  40.22 
 
 		 639 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  40.29 
 
 		 650 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  40.52 
 
 		 650 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  40.13 
 
 		 670 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  41.96 
 
 		 663 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  39.71 
 
 		 632 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>