More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2769 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2769  putative acetyl-CoA synthetase and ligase  100 
 
 
650 aa  1328    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914995  normal  0.208075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1711  AMP-dependent synthetase and ligase  50.25 
 
 
653 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.103973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1750  AMP-dependent synthetase and ligase  46.78 
 
 
636 aa  558  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0604135 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1641  AMP-dependent synthetase and ligase  48.48 
 
 
656 aa  553  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  39.04 
 
 
652 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  40.13 
 
 
643 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  42.2 
 
 
656 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  41.99 
 
 
648 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  41.25 
 
 
649 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  40.6 
 
 
652 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  37.65 
 
 
657 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  41.97 
 
 
660 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  37.48 
 
 
666 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  38.65 
 
 
655 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  39.51 
 
 
649 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  39.97 
 
 
660 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  39.43 
 
 
667 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  39.39 
 
 
656 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  39.49 
 
 
658 aa  451  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  37.95 
 
 
649 aa  451  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  38.1 
 
 
667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  40.4 
 
 
651 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  39.84 
 
 
655 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  39.84 
 
 
655 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  40.72 
 
 
715 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  40.89 
 
 
661 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  42.08 
 
 
653 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  36.39 
 
 
664 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  37.64 
 
 
636 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  38.1 
 
 
667 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  38.71 
 
 
638 aa  442  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  37.48 
 
 
636 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  37.64 
 
 
636 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  38.72 
 
 
638 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  39.9 
 
 
649 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  38.54 
 
 
657 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  40 
 
 
656 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  38.2 
 
 
655 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  39.57 
 
 
661 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  39.27 
 
 
632 aa  435  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  39.94 
 
 
663 aa  435  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  39.28 
 
 
656 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  40.07 
 
 
659 aa  432  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  37.96 
 
 
655 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  40.07 
 
 
629 aa  431  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  39.94 
 
 
647 aa  432  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  38.05 
 
 
657 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  37.63 
 
 
663 aa  429  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  39.8 
 
 
661 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  39.29 
 
 
649 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  39.38 
 
 
645 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  41.5 
 
 
654 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  40.5 
 
 
661 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  39.54 
 
 
658 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  39.44 
 
 
656 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  37.86 
 
 
657 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  39.22 
 
 
645 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  41.34 
 
 
651 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  37.92 
 
 
655 aa  425  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  37.36 
 
 
658 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  37.23 
 
 
652 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  38.93 
 
 
666 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  38.69 
 
 
661 aa  422  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  40.22 
 
 
655 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  39.24 
 
 
667 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  38.83 
 
 
645 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  38.51 
 
 
660 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  38.75 
 
 
645 aa  422  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  39 
 
 
645 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  37.27 
 
 
664 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  38.2 
 
 
644 aa  422  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  40 
 
 
657 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  40.67 
 
 
664 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  38.51 
 
 
660 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  37.38 
 
 
652 aa  422  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  38.76 
 
 
661 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  37.23 
 
 
652 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4783  acetyl-CoA synthetase  38.59 
 
 
649 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  39.43 
 
 
639 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  37.87 
 
 
658 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5208  acetyl-CoA synthetase  38.59 
 
 
649 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42750  acetyl-CoA synthetase  39.8 
 
 
645 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.74253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  37.7 
 
 
647 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  38.8 
 
 
651 aa  418  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  39.13 
 
 
656 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  37.7 
 
 
658 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  37.58 
 
 
666 aa  414  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  38.3 
 
 
644 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  37.97 
 
 
652 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  37.1 
 
 
631 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  39.45 
 
 
655 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  36.36 
 
 
635 aa  415  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  38.06 
 
 
654 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  37.36 
 
 
650 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5598  acetyl-CoA synthetase  37.68 
 
 
648 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438623  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1226  acetyl-CoA synthetase  38.83 
 
 
645 aa  415  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255134 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  37.8 
 
 
652 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  36.97 
 
 
664 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  36.25 
 
 
656 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  38.54 
 
 
644 aa  415  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>