More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0495 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  100 
 
 		 798 aa  1581    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 502 aa  171  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  40.68 
 
 		 278 aa  168  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  32.94 
 
 		 504 aa  164  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 		 565 aa  163  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.2 
 
 		 514 aa  161  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  47.94 
 
 		 283 aa  160  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  40.07 
 
 		 291 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  33.04 
 
 		 503 aa  158  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3958  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 707 aa  158  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  31.27 
 
 		 504 aa  157  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 520 aa  157  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0879  hypothetical protein  39.39 
 
 		 329 aa  156  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.48 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  32.43 
 
 		 518 aa  156  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 578 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  34.38 
 
 		 570 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  31.32 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1674  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 482 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 521 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  34.38 
 
 		 521 aa  155  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 521 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 507 aa  155  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 521 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 474 aa  155  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 521 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  31.27 
 
 		 503 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  28.94 
 
 		 504 aa  154  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 731 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  32.15 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  31.96 
 
 		 506 aa  153  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  31.56 
 
 		 507 aa  152  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  31.13 
 
 		 526 aa  152  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 		 510 aa  152  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  32.65 
 
 		 505 aa  151  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 577 aa  151  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  32.56 
 
 		 501 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 525 aa  151  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 591 aa  151  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  32.27 
 
 		 501 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  26.81 
 
 		 506 aa  150  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 568 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  33.63 
 
 		 510 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 560 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 585 aa  149  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  33.14 
 
 		 503 aa  149  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 506 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  32.35 
 
 		 510 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  28.83 
 
 		 504 aa  148  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  30.38 
 
 		 504 aa  148  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 500 aa  147  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  30.35 
 
 		 503 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 520 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 499 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  32.65 
 
 		 509 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 558 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.09 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  31.56 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  33.53 
 
 		 512 aa  145  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  30.75 
 
 		 507 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 510 aa  145  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 498 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3397  putative acyl-CoA synthetase  27.25 
 
 		 487 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000328884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  30.47 
 
 		 510 aa  144  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  29.5 
 
 		 510 aa  144  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 		 539 aa  144  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  30.92 
 
 		 500 aa  144  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 519 aa  144  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 662 aa  144  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 520 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2558  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 		 520 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  32.57 
 
 		 548 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 		 591 aa  143  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2582  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 		 520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  29 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.24 
 
 		 513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  31.21 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 520 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  30.3 
 
 		 575 aa  142  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  32.29 
 
 		 548 aa  142  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  32.29 
 
 		 548 aa  142  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  31.18 
 
 		 504 aa  142  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 583 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1947  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 520 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.2 
 
 		 583 aa  141  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  43.07 
 
 		 301 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 559 aa  141  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 583 aa  141  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 564 aa  140  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.11 
 
 		 516 aa  140  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  26.38 
 
 		 506 aa  140  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 508 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3431  AMP-dependent synthetase and ligase  33.43 
 
 		 507 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  30.23 
 
 		 577 aa  140  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 566 aa  140  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.909575  hitchhiker  0.000208439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  28.88 
 
 		 522 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  34.04 
 
 		 520 aa  140  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 553 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>