More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0434 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  87.21 
 
 		 524 aa  920    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 563 aa  1115    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  77.3 
 
 		 559 aa  853    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 		 562 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 557 aa  327  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 557 aa  327  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  41.67 
 
 		 568 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  45.06 
 
 		 615 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  40.5 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  38.45 
 
 		 563 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 563 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  40.91 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 		 563 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  41.41 
 
 		 455 aa  256  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 565 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  41.39 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  40.51 
 
 		 454 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  36.09 
 
 		 466 aa  253  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  40.26 
 
 		 454 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  40.26 
 
 		 454 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  40.26 
 
 		 454 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  39.14 
 
 		 454 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  40.67 
 
 		 454 aa  249  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  40.26 
 
 		 454 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  40.26 
 
 		 454 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  40.26 
 
 		 454 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  40.26 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  38.76 
 
 		 454 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  40.36 
 
 		 453 aa  239  9e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  31.29 
 
 		 457 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  35.84 
 
 		 591 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  35.24 
 
 		 427 aa  195  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  35.76 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.1 
 
 		 518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  28.08 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 451 aa  166  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  26.22 
 
 		 448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  31.07 
 
 		 609 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  25.12 
 
 		 593 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  30.22 
 
 		 609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3892  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  43.1 
 
 		 128 aa  103  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  29.13 
 
 		 584 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  26.03 
 
 		 570 aa  100  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.44 
 
 		 565 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  28.63 
 
 		 590 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  28.63 
 
 		 590 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0336  thioester dehydrase family protein  42.11 
 
 		 134 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4372  thioester dehydrase family protein  42.34 
 
 		 124 aa  94  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  41.23 
 
 		 134 aa  93.6  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  47.32 
 
 		 114 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0346  thioester dehydrase family protein  41.23 
 
 		 134 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  42.34 
 
 		 124 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  42.34 
 
 		 124 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  42.34 
 
 		 124 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.17 
 
 		 565 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0442  thioester dehydrase family protein  42.11 
 
 		 137 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0338  thioester dehydrase family protein  41.23 
 
 		 134 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4600  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  39.82 
 
 		 125 aa  91.3  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  28.95 
 
 		 435 aa  90.9  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3383  thioester dehydrase family protein  40.71 
 
 		 120 aa  90.5  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  27.09 
 
 		 580 aa  90.1  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  29.18 
 
 		 450 aa  89.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0321  thioester dehydrase family protein  39.82 
 
 		 125 aa  87.4  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  26.87 
 
 		 448 aa  87  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2099  hypothetical protein  38.46 
 
 		 124 aa  85.5  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0348  thioester dehydrase family protein  38.6 
 
 		 130 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.69 
 
 		 569 aa  84  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3515  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  36.28 
 
 		 123 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  28.68 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  29.32 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  27.69 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  25.53 
 
 		 5149 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004068  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  39.45 
 
 		 122 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  24.8 
 
 		 4502 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  25 
 
 		 4136 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  24.68 
 
 		 4991 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  24.33 
 
 		 5654 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  27.87 
 
 		 1130 aa  72  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4573  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.78 
 
 		 129 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4805  putative (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  35.96 
 
 		 117 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3890  putative (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  38.68 
 
 		 117 aa  67.4  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  25.57 
 
 		 2350 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  25.24 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  24.94 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  25.27 
 
 		 2875 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  24.9 
 
 		 4449 aa  63.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1576  putative acetyl-coa synthetase  22.78 
 
 		 628 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  27.39 
 
 		 3629 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0113  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-[acyl- carrier-protein] dehydratase  26.23 
 
 		 126 aa  61.6  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  24.57 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  34.71 
 
 		 658 aa  61.2  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  25.14 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1847  amino acid adenylation  23.97 
 
 		 1070 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  23.49 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.02 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>