72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0338 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0338  thioester dehydrase family protein  100 
 
 
134 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  99.25 
 
 
134 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0336  thioester dehydrase family protein  97.76 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0346  thioester dehydrase family protein  96.27 
 
 
134 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0442  thioester dehydrase family protein  84.67 
 
 
137 aa  231  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4372  thioester dehydrase family protein  87.07 
 
 
124 aa  208  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  85.34 
 
 
124 aa  206  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  85.34 
 
 
124 aa  206  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  84.48 
 
 
124 aa  205  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4600  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  68.38 
 
 
125 aa  170  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3383  thioester dehydrase family protein  68.75 
 
 
120 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0321  thioester dehydrase family protein  62.5 
 
 
125 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3892  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  62.93 
 
 
128 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3515  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  64.91 
 
 
123 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0348  thioester dehydrase family protein  57.81 
 
 
130 aa  144  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  41.23 
 
 
563 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  45.28 
 
 
559 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  41.82 
 
 
524 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  42.55 
 
 
561 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  38.53 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4573  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  41.58 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004068  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  39.29 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2099  hypothetical protein  36.52 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 
615 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
562 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 
565 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
568 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 
557 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 
557 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 
557 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 
563 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3890  putative (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  37 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4805  putative (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  35 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 
551 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
563 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0113  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-[acyl- carrier-protein] dehydratase  30 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  29.41 
 
 
591 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  28.57 
 
 
563 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
593 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0436  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  28.57 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.28393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3298  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  36.79 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4961  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.28459e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5401  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000205722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5551  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963148  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5399  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000134104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5454  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5076  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000655329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4758  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.57 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.12941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 
570 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3797  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000652918  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1728  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.78 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.770808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5357  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5116  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000186876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5508  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000439699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4963  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.45 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000238321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2747  hypothetical protein  32.93 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.168123  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0677  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.67 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_55157  3R-hydroxyacyl-[acyl carrier protein] dehydrase  27.66 
 
 
197 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2625  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.23 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000137292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3097  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  32.38 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000414078  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1586  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  26.44 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000412753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2353  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  27.37 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0023817  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.77 
 
 
518 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0915  hypothetical protein  29.41 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3042  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.07 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462423  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.11 
 
 
565 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1106  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  25 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.512936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  31.46 
 
 
580 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.03 
 
 
565 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1706  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.76 
 
 
169 aa  40.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0205263  normal  0.629658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1527  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.76 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000569467  decreased coverage  0.0070986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1905  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.17 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000023951  normal  0.338471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>