More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3671 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  100 
 
 		 411 aa  821    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  34.42 
 
 		 403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1819  4-coumarate--CoA ligase  32.85 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0064272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0103  4-coumarate--CoA ligase  33.22 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 		 568 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 615 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  28.3 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  26.01 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  25.45 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3397  putative acyl-CoA synthetase  23.49 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000328884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  27.3 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  36.04 
 
 		 643 aa  72.8  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  29.46 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  24.76 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  34.91 
 
 		 652 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  28.08 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  26.23 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  27.48 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00054  Adenylate-forming enzymePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870J3]  25.45 
 
 		 583 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  25.07 
 
 		 583 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  36.79 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  25 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 555 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  40.37 
 
 		 1035 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1674  AMP-dependent synthetase and ligase  24.56 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  33.96 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  39.57 
 
 		 3294 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3902  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  30.6 
 
 		 591 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  34.91 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3828  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  39.57 
 
 		 3297 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  39.57 
 
 		 3294 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  35.85 
 
 		 659 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  35.85 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  33.96 
 
 		 660 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  34.91 
 
 		 661 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  32.08 
 
 		 650 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  24.56 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  25.22 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1020  propionyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 627 aa  59.7  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  37.14 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  32.08 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  24.04 
 
 		 565 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  30.19 
 
 		 631 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1562  propionyl-CoA synthetase  33.96 
 
 		 625 aa  59.3  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.96 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  33.96 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5208  acetyl-CoA synthetase  33.96 
 
 		 649 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  23.19 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  31.13 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4783  acetyl-CoA synthetase  33.96 
 
 		 649 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  33.03 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  25.58 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.26 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  22.38 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  31.13 
 
 		 649 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  30.19 
 
 		 658 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3396  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.28 
 
 		 809 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  35.92 
 
 		 655 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  35.78 
 
 		 670 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  26.63 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  30.19 
 
 		 658 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  32.08 
 
 		 656 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  22.82 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  31.09 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 655 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  23.05 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  26.63 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  26.63 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  23.05 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  22.25 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  23.05 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  26.63 
 
 		 650 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3974  acetyl-CoA synthetase  29.38 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162382  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1000  AMP-dependent synthetase and ligase  27.04 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00216584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  26.64 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3524  acyl-CoA synthetase  25 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12114  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  38.46 
 
 		 3290 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 650 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1381  acetyl-CoA synthetase  26.25 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.319364  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  36.45 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  33.33 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 650 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>