More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2937 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 494 aa  1008    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 		 478 aa  336  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1365  AMP-dependent synthetase and ligase  40.13 
 
 		 477 aa  335  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0952  AMP-dependent synthetase and ligase  40.6 
 
 		 478 aa  334  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2910  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 		 477 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3920  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  32.37 
 
 		 504 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1424  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  33.11 
 
 		 504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1259  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  33.11 
 
 		 504 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1461  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  33.11 
 
 		 504 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1261  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  32.89 
 
 		 504 aa  243  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1530  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  32.68 
 
 		 504 aa  242  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1294  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  32.68 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.711083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1487  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  32.68 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1287  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  32.75 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1389  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  32.75 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1374  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.13 
 
 		 499 aa  240  4e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1092  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.99 
 
 		 504 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1793  amino acid adenylation domain protein  36.42 
 
 		 516 aa  239  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.787997  normal  0.406498 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0252  D-alanine-activating enzyme  30.65 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 		 516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.685068  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0518  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  33.71 
 
 		 485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0165  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  33.26 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000579194  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1817  D-alanine-activating enzyme  32.6 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1818  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  32.36 
 
 		 502 aa  226  8e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000381678  hitchhiker  0.00010447 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1790  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.88 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 519 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0932  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.57 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.210053  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0951  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.57 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0802  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.46 
 
 		 516 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  32.93 
 
 		 5469 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0093  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  30.47 
 
 		 5372 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  31.92 
 
 		 13537 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  30.15 
 
 		 2419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  32.3 
 
 		 3470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  33.47 
 
 		 7712 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  30.3 
 
 		 1466 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0576  amino acid adenylation domain protein  27.44 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  29.9 
 
 		 1466 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  33.2 
 
 		 2943 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  31.34 
 
 		 6272 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  29.26 
 
 		 2386 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.23 
 
 		 1776 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  33.12 
 
 		 4383 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  31.55 
 
 		 2626 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  31.14 
 
 		 6271 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  31.14 
 
 		 6274 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  31.34 
 
 		 6202 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  31.12 
 
 		 1789 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  30.45 
 
 		 2174 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  31.57 
 
 		 4449 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  29.92 
 
 		 2174 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.98 
 
 		 5926 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  33.06 
 
 		 3331 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  31.66 
 
 		 4354 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  32.9 
 
 		 3639 aa  176  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  30.97 
 
 		 4317 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  30.1 
 
 		 2581 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  30.43 
 
 		 2201 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  33.05 
 
 		 8211 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  28.92 
 
 		 9175 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  29.17 
 
 		 1870 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  29.17 
 
 		 1870 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  28.16 
 
 		 7168 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  31.35 
 
 		 2137 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  32.2 
 
 		 2448 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  29.8 
 
 		 5149 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  30.1 
 
 		 6176 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  28.89 
 
 		 3432 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.65 
 
 		 6676 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4588  amino acid adenylation domain protein  31.68 
 
 		 1925 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3891  amino acid adenylation domain protein  32.34 
 
 		 1256 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  34.2 
 
 		 2651 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  30.23 
 
 		 5929 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1439 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.14 
 
 		 2720 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  29.2 
 
 		 1518 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  30.82 
 
 		 3168 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  28.66 
 
 		 5738 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  30.02 
 
 		 9498 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  29.39 
 
 		 1518 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  29.61 
 
 		 4991 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  31.98 
 
 		 1131 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  29.88 
 
 		 2666 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  30.29 
 
 		 2154 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  29.54 
 
 		 8646 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.38 
 
 		 4531 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.4 
 
 		 1829 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00607  ferricrocin synthetase (nonribosomal peptide siderophore synthase ) (Eurofung)  33.51 
 
 		 4761 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.481036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  32.16 
 
 		 1137 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  30.04 
 
 		 5654 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  28.93 
 
 		 2273 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  29.92 
 
 		 1282 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  29.86 
 
 		 1518 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  31.67 
 
 		 1405 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  27.79 
 
 		 3086 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  29.03 
 
 		 627 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3702  non ribosomal peptide synthase  30.71 
 
 		 1134 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3545  amino acid adenylation domain-containing protein  30.06 
 
 		 1029 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>