181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2358 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  100 
 
 		 263 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  42.21 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  39.11 
 
 		 281 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  36.47 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  39.69 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  41.43 
 
 		 275 aa  181  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  40 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  39.92 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  36.43 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  37.21 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  38.39 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  35 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  32.73 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  30.98 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  29.84 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  28.4 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  29.83 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  30.37 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  28.21 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  31.84 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 367 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  34.64 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  32.89 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.98 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.28 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.98 
 
 		 446 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  29.9 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.98 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  30.26 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 391 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  30 
 
 		 384 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  35.98 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  29.74 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  33.04 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  33.04 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  33.97 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  30.67 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  25.6 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0647  polysaccharide export system, outer membrane component  26.67 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  28.08 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  34.18 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  32.64 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  33.11 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.22 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.22 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  32.59 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.22 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.22 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.22 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.22 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.22 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  32.59 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  29.03 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  26.52 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  31.67 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  31.54 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  32.9 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  31.67 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  28.87 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  32.23 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.99 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  31.51 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  33.14 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  24.88 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  31.51 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  27.66 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  38.37 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  30.97 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  32.39 
 
 		 387 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  30.97 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3844  polysaccharide export periplasmic protein  22.17 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  25.16 
 
 		 193 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  32.58 
 
 		 396 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  29.46 
 
 		 393 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 376 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  30.16 
 
 		 196 aa  52.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 423 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  32.17 
 
 		 408 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 423 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  26.62 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  30.21 
 
 		 383 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  32.17 
 
 		 407 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  30.48 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>