223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6308 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  100 
 
 		 276 aa  554  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  42.4 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  42.91 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  40.65 
 
 		 275 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  40.32 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  36.19 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  37.21 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  36.8 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  33.98 
 
 		 266 aa  148  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  33.73 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  33.94 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  33.04 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  29.7 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  25.94 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 247 aa  93.2  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  25.6 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  33.77 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  30.63 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  33.51 
 
 		 426 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  32.98 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  32.48 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  31.96 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  30.92 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  29.86 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 385 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  33.15 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.37 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  33.55 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  33.55 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.56 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  32.37 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  30.65 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  32 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3844  polysaccharide export periplasmic protein  25.46 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  27.07 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.63 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.01 
 
 		 446 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.01 
 
 		 400 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  30.39 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  30.34 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  31.63 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  27.6 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.78 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  28.49 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  40.4 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  30.11 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  42.25 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  35 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  32.19 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.32 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  25.52 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.06 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  34.19 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  27.54 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0647  polysaccharide export system, outer membrane component  27.87 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  31.51 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  27.86 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  34.75 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  33.57 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  25.77 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  33.01 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  26.81 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  33.63 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  26.98 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  29.38 
 
 		 440 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  32.38 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  31.3 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  30.47 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.95 
 
 		 396 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  32.84 
 
 		 192 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  28.28 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  35.92 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  31.3 
 
 		 387 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4112  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  31.3 
 
 		 387 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  28.67 
 
 		 191 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  32.17 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 386 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  34.95 
 
 		 391 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>