237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10728 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  100 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  39.92 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  40.72 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  37 
 
 		 307 aa  168  9e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  39.09 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  36.98 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  37.55 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  36.27 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  36.57 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  35.22 
 
 		 254 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  33.08 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  33.04 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  36.48 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  30.23 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  32.71 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  32.38 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  25.28 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  25.28 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  31.91 
 
 		 393 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  33.82 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  33.82 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  33.09 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  31.09 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  31.13 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  26.92 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  28.16 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  30.16 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  28.16 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  32.35 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  33.63 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  28.16 
 
 		 391 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.67 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.67 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.67 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.67 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.67 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.67 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.67 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  27.72 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  31.15 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  34.09 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 392 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.57 
 
 		 396 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.16 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.16 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.16 
 
 		 422 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  29.49 
 
 		 428 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.7 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  28.43 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  28.39 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  31.37 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  30 
 
 		 508 aa  55.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  29.33 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  31.62 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  25.16 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  31.53 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  31.53 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  31.53 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  36 
 
 		 152 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  34.78 
 
 		 435 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  30.1 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.53 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  31.53 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  36.46 
 
 		 153 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.53 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.53 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.53 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  28.93 
 
 		 948 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  27.94 
 
 		 446 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  25 
 
 		 384 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.63 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 407 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  27.52 
 
 		 426 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  26.62 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  28.95 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  26.89 
 
 		 407 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  23.9 
 
 		 378 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  30.09 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 372 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  36.62 
 
 		 478 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  25.79 
 
 		 385 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.1 
 
 		 396 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  32.09 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.1 
 
 		 391 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  29.3 
 
 		 423 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  29.3 
 
 		 423 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>