121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0845 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  30.12 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  31.2 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  30.04 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  28.4 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  28.33 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  28.4 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  28.83 
 
 		 283 aa  99  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  29.06 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  31.8 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  25.6 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  27.38 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  25.76 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  25.58 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  25.53 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  28.21 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  24.31 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  28.75 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  24.86 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  27.03 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  26.64 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  26.17 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  25.23 
 
 		 397 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.85 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  23.12 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  25.74 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.61 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.61 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.61 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.61 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.61 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 431 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  22.22 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  29.1 
 
 		 378 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  28.36 
 
 		 379 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  25.94 
 
 		 393 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  25.75 
 
 		 495 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  24.84 
 
 		 348 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  22.92 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.87 
 
 		 378 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  27.61 
 
 		 379 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  27.61 
 
 		 379 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.61 
 
 		 379 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  27.61 
 
 		 379 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.61 
 
 		 379 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.61 
 
 		 379 aa  52.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.61 
 
 		 379 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  27.61 
 
 		 379 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  24.82 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  26.27 
 
 		 391 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 580 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  24.31 
 
 		 417 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  23.76 
 
 		 378 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0647  polysaccharide export system, outer membrane component  23.59 
 
 		 358 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 379 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  26.21 
 
 		 390 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  28.36 
 
 		 379 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  28.36 
 
 		 379 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.36 
 
 		 386 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.36 
 
 		 386 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  28.36 
 
 		 379 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.36 
 
 		 379 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  28.36 
 
 		 379 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3844  polysaccharide export periplasmic protein  24.45 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  26.27 
 
 		 385 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.36 
 
 		 386 aa  49.3  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  25.42 
 
 		 391 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  23.57 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  25.5 
 
 		 348 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  28.12 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 387 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  27.22 
 
 		 371 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  22.54 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  29.07 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  28.79 
 
 		 372 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  23.13 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  24.64 
 
 		 407 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  27 
 
 		 392 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  21.32 
 
 		 446 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  24.02 
 
 		 350 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  21.32 
 
 		 400 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  22 
 
 		 422 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  25.51 
 
 		 379 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 191 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  26.74 
 
 		 391 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  25.12 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  23.19 
 
 		 192 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  29.63 
 
 		 195 aa  45.4  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  25.87 
 
 		 407 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>