80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07225 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  100 
 
 		 257 aa  516  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  47.69 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  30.95 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  34.2 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  28.17 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  31.4 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  30.47 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  29.69 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  30.08 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  28.74 
 
 		 263 aa  95.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  29.91 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  31.42 
 
 		 276 aa  88.6  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  26.53 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  26.24 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  25.67 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  26.46 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  26.15 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.07 
 
 		 400 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  25.13 
 
 		 384 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.07 
 
 		 446 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 417 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  36.89 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  31.41 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.67 
 
 		 422 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.97 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 385 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  28.87 
 
 		 390 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 391 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  35 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  26.29 
 
 		 391 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3844  polysaccharide export periplasmic protein  20.87 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  35.63 
 
 		 351 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  27.34 
 
 		 454 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  27.34 
 
 		 384 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 379 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  32.73 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 398 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  28.48 
 
 		 390 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 423 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 423 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 383 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  28.93 
 
 		 350 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1414  polysaccharide export protein  33.55 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.805947  normal  0.562066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 389 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  27.4 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 407 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  31.76 
 
 		 388 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 392 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 408 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  30.97 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  24.34 
 
 		 379 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  33.98 
 
 		 391 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  27.78 
 
 		 393 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  30.17 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  22.22 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  31.25 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  27.68 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  27.68 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  30.94 
 
 		 417 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  22.22 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  31.13 
 
 		 390 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  25 
 
 		 426 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  24.82 
 
 		 193 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  28.87 
 
 		 352 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  32.19 
 
 		 387 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  33.02 
 
 		 387 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  24.75 
 
 		 362 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  27.45 
 
 		 189 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  28.85 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 196 aa  42.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 196 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  28.8 
 
 		 386 aa  42.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  30.32 
 
 		 377 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  25 
 
 		 185 aa  42  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>