38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3844 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3844  polysaccharide export periplasmic protein  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  25.46 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  22.75 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  24.43 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  24.81 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  21.37 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  23.9 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  23.18 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  21.88 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  22.17 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  23.4 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  28.21 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  20.98 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  24.45 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  28.28 
 
 		 426 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  28 
 
 		 492 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  21.03 
 
 		 275 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  23.29 
 
 		 275 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 397 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  21.46 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  23.08 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  26.42 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  23.81 
 
 		 387 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  28.28 
 
 		 426 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  21.81 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  25.31 
 
 		 390 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  35.85 
 
 		 495 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  22.88 
 
 		 384 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  29.58 
 
 		 333 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  23.68 
 
 		 390 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 495 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2112  endo-alpha-N-acetylgalactosaminidase  21.58 
 
 		 1458 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 387 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 495 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  25.49 
 
 		 389 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 407 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  29.77 
 
 		 407 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>