118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3051 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  534  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  49.38 
 
 
262 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  44.98 
 
 
250 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  40.21 
 
 
281 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  45.83 
 
 
247 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  40.09 
 
 
258 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  39.02 
 
 
210 aa  148  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  36.16 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  32.98 
 
 
262 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  34.92 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  36.32 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  30.71 
 
 
254 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
241 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  34 
 
 
201 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  30.08 
 
 
254 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  29.27 
 
 
278 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  31 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
332 aa  86.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  28.28 
 
 
282 aa  85.9  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  30.04 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  26.95 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  29.25 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  28.97 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  29.03 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  29.2 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  29.59 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  28.22 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  28.86 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  28.44 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  30.24 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  26.64 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  26.64 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  26.64 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  25.98 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  26.15 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  27.6 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  25.95 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  26.25 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  27.06 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  24.22 
 
 
287 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  25.87 
 
 
270 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  25.48 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  25.12 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  25.98 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  26.5 
 
 
284 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  29.25 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  28.92 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.5 
 
 
251 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  25.43 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  26.77 
 
 
193 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.71 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
231 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.01 
 
 
256 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
244 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2622  Methyltransferase type 11  24.64 
 
 
191 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.179692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.06 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.01 
 
 
271 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  25.4 
 
 
332 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.59 
 
 
251 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.59 
 
 
251 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
202 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.59 
 
 
251 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.59 
 
 
251 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.03 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.53 
 
 
260 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 
244 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  32.81 
 
 
251 aa  45.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.13 
 
 
251 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  31.5 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  31.5 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.78 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  31.5 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.92 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.78 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.56 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  31.75 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.56 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.78 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.47 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.47 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.3 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.92 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.23 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  27.32 
 
 
184 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  29.92 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  31.43 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.45 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  55.26 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>