153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0177 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  45.58 
 
 		 249 aa  178  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  37.09 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 241 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  37.17 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  39.35 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  38.71 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  38.18 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  37.5 
 
 		 258 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 201 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  38.36 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  31.32 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  32.7 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  29.89 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  28.17 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  26.67 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  32.11 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  26.1 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  26.46 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  27.57 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  26.34 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  27.73 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  30.09 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  27.73 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  28.85 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  24.82 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  27.76 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  27.56 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  27.8 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  25.2 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.01 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  26.83 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  27.22 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  32.85 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  32.85 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  32.85 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  32.85 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  27.11 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  26.74 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  27.43 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  26.67 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  34.06 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  24.64 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  24.87 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  27.32 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  26.82 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  31.58 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.07 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.59 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  23.11 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  25.11 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 397 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.5 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  22.49 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 243 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  25.56 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.5 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.01 
 
 		 374 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.68 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  23.7 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.23 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.12 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2970  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.69 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2818  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.69 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  32.28 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.11 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.01 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.01 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.01 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.26 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  28.68 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.01 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.01 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.13 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.01 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.01 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.76 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.03 
 
 		 373 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.01 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  31.01 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.91 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.21 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>