88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4519 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  44.13 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  40.09 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  45.54 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  40.26 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  37.4 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  34.92 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  30.53 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  35.75 
 
 		 210 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  31.67 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 201 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  31.22 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  29.04 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  30.04 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  27.54 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  26.81 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  30.27 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  28.62 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  30.38 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  28.85 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  26.21 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  28.14 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  29.62 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  25.74 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  26.27 
 
 		 332 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  29.25 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  27.88 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  27.69 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  28.19 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  29.46 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  26.59 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  26.67 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  26.67 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  25.48 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  26.25 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  26.67 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  26.45 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  25.29 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  26.03 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  25.39 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  27.17 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  25.62 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  27.85 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 278 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.99 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  25.83 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.26 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.26 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.26 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.26 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.26 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.26 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.26 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.12 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.12 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.06 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.54 
 
 		 237 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.54 
 
 		 237 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  29.32 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.88 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.94 
 
 		 215 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.54 
 
 		 237 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0069  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  29.13 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  26.06 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.03 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.84 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1326  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.69 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0225  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  23.73 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000107997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  22.89 
 
 		 251 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.89 
 
 		 242 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>