55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2291 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  100 
 
 		 332 aa  674    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  58.23 
 
 		 267 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  54.73 
 
 		 276 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  48.94 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  48.91 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  47.84 
 
 		 278 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  49.8 
 
 		 284 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  44.83 
 
 		 270 aa  225  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  45.52 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  44.48 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  44.48 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  43.64 
 
 		 270 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  46.18 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  44.25 
 
 		 276 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  44.1 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  43.36 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  43.75 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  48.26 
 
 		 284 aa  215  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  43.4 
 
 		 270 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  48.83 
 
 		 285 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  43.4 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  47.08 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  42.23 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  49 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  46.18 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  48.37 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  47.6 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  49.41 
 
 		 280 aa  205  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  47.24 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  47.9 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  49.41 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  45.9 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  39.52 
 
 		 284 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  38.31 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  31.94 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  30.52 
 
 		 267 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  30.49 
 
 		 250 aa  86.3  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  28.44 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  30.23 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  31.9 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  31.44 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  27.94 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  28.63 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  29.49 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  27.24 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 186 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  25.31 
 
 		 189 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 270 aa  46.2  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  25.75 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  30.95 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  30.36 
 
 		 255 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>