48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1731 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  593  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  63.7 
 
 		 289 aa  358  7e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  58.95 
 
 		 276 aa  348  6e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  65.31 
 
 		 270 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  64.9 
 
 		 270 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  64.49 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  64.49 
 
 		 270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  63.37 
 
 		 276 aa  332  5e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  57.09 
 
 		 276 aa  331  9e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  64.08 
 
 		 270 aa  331  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  62 
 
 		 270 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  62.86 
 
 		 270 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  62.86 
 
 		 270 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  62.04 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  58.94 
 
 		 282 aa  308  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  59.76 
 
 		 276 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  49.12 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  48.59 
 
 		 285 aa  227  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  48.4 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  46.21 
 
 		 282 aa  224  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  47.76 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  43.06 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  45.56 
 
 		 332 aa  219  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  48 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  48.97 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  43.15 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  43.15 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  43.04 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  39.93 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  42.69 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  41.24 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  44 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  34 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  32.01 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  32.63 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  27.86 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  30.7 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  27.73 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  25.46 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  26.85 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  25.39 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  24.38 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  24.76 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  25.19 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  24.56 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>