60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4274 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  534  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  39.57 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  41.11 
 
 		 249 aa  158  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  37.17 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  36.02 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  37.32 
 
 		 201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  36.52 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  36 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  34.85 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  32.35 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  35.22 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  31.62 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  27.17 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  26.98 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  27.17 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  27.34 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  27.17 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  27.17 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  28.42 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  25.95 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  26.9 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  25.26 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  27.11 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 332 aa  62  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  24.58 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  23.51 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  27.09 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  24.8 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  23.53 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  23.91 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  27.78 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  23.78 
 
 		 397 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  25.77 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  24.38 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  23.05 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  31.97 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  24.32 
 
 		 332 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  25.21 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  21.95 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  22.87 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  24.43 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  24.58 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  23.88 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  45.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  23.46 
 
 		 294 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  28.24 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  24.19 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  25.14 
 
 		 188 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  44 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  22.45 
 
 		 217 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  25.87 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2163  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  27.63 
 
 		 207 aa  42.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000531315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  32.65 
 
 		 415 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>