48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2450 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  73.45 
 
 		 276 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  70.88 
 
 		 276 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  65.35 
 
 		 282 aa  350  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  60.3 
 
 		 289 aa  349  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  60.51 
 
 		 270 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  58.95 
 
 		 287 aa  348  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  60.14 
 
 		 270 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  60.87 
 
 		 270 aa  348  8e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  60.14 
 
 		 270 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  60.51 
 
 		 270 aa  345  4e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  59.42 
 
 		 270 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  57.97 
 
 		 270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  57.97 
 
 		 270 aa  334  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  57.97 
 
 		 270 aa  333  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  54.91 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  49.48 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  48 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  48.37 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  45.2 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  48.4 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  46.51 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  46.12 
 
 		 310 aa  221  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  49.39 
 
 		 267 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  42.91 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  46.04 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  47.93 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  43.04 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  43.37 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  43.28 
 
 		 268 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  43.32 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  46.18 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  36.8 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  32.5 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  34.29 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  30.95 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  25.4 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  26.67 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  26.61 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  27.36 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  27.8 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  27.45 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  23.91 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  24.07 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  24.78 
 
 		 201 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  26.76 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>