48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1759 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  86.62 
 
 		 270 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  86.25 
 
 		 270 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  86.25 
 
 		 270 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  85.5 
 
 		 270 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  82.96 
 
 		 270 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  81.85 
 
 		 270 aa  482  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  81.48 
 
 		 270 aa  480  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  81.48 
 
 		 270 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  60.87 
 
 		 276 aa  348  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  60.07 
 
 		 276 aa  346  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  66.94 
 
 		 289 aa  345  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  61.05 
 
 		 276 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  64.08 
 
 		 287 aa  331  9e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  60.47 
 
 		 282 aa  324  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  55.26 
 
 		 276 aa  301  9e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  49.61 
 
 		 284 aa  251  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  47.13 
 
 		 285 aa  234  8e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  48.4 
 
 		 278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  44.13 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  42.91 
 
 		 282 aa  222  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  43.6 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  48.57 
 
 		 332 aa  216  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  43.65 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  43.9 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  45.72 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  43.25 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  45.56 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  44.3 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  44.36 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  44.31 
 
 		 310 aa  201  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  42.8 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  34.01 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  31.91 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  32.74 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  30.19 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  26.29 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  25.29 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  22.48 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  26.15 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  26.27 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  25.66 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  25.93 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  27.09 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  25.11 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  23.87 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  23.3 
 
 		 397 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>