81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5491 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  100 
 
 
281 aa  568  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  49.33 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  43.53 
 
 
258 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  43.67 
 
 
267 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  36.16 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  39.57 
 
 
262 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  45.79 
 
 
247 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  40.71 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  41.52 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  39.38 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  39.81 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  33.8 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
201 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  34.98 
 
 
254 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  34.76 
 
 
254 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  31.89 
 
 
282 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  32.13 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  31.46 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  30.33 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  31.65 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  31.48 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  30.09 
 
 
270 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  30.73 
 
 
270 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  30.36 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  32.13 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  29.91 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  30.99 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  29.36 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  29.39 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  30.62 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  30.8 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  27.71 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  29.17 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  29.17 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  29.17 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  30.04 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  32.75 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  31.16 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  32.75 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  29.96 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  30.04 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  30.43 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  29.76 
 
 
332 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  30.73 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  31.36 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  31.28 
 
 
289 aa  72  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  30 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  29.36 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  32.53 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  29.51 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  31.31 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  26.54 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
217 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 
397 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  29.44 
 
 
278 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
187 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  24.72 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
202 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
231 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  24.62 
 
 
251 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  29.11 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 
237 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  26.71 
 
 
184 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
199 aa  45.8  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  36.9 
 
 
429 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  36.9 
 
 
429 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  23.6 
 
 
255 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  25.71 
 
 
190 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.87 
 
 
209 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  28 
 
 
206 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1003  methyltransferase type 11  37.68 
 
 
180 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00822165  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  31.01 
 
 
216 aa  42  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>