51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3092 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  50.18 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  53.72 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  48.7 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  48.33 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  47.58 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  46.01 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  47.58 
 
 		 270 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  46.84 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  47.67 
 
 		 276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  45.72 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  48.4 
 
 		 270 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  45.72 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  45.2 
 
 		 276 aa  232  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  45.35 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  51.93 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  51.23 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  49.17 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  47.76 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  48.75 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  45.13 
 
 		 284 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  48.31 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  44.2 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  46.72 
 
 		 289 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  47.5 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  45.32 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  44.65 
 
 		 290 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  44.69 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  45.63 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  47.97 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  43.9 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  43.8 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  31.73 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  35.54 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  34.2 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  29.51 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  29.91 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  29.96 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  27.64 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  28.23 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  26.78 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  27.11 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  25.64 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  29.83 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  24.82 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  25.66 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 208 aa  42  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>