241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3596 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  58.79 
 
 		 201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  53.02 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  38.5 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  40.44 
 
 		 281 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  38.39 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  35.22 
 
 		 250 aa  135  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  36 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  33.94 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  31.28 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  32.61 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  32.3 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  30.38 
 
 		 332 aa  89.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  28.52 
 
 		 282 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  28.03 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  27.97 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  30.71 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  28.4 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  28.4 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  31.66 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  29.41 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  26.67 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  28 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  25.79 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  28.74 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  28.81 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  27.67 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  28.64 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  25.72 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  27.43 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  28.63 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  26.74 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  24.19 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  24.22 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  22.48 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  25.23 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  25.67 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  24.02 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.69 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  24.6 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  25.23 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  29.44 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  23.46 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  24.77 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.11 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.11 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.11 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  22.79 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  22.02 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  26 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  22.02 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.97 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  22.02 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.21 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  31.25 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.4 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  30.9 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.25 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  27.27 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.85 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.85 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.85 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.85 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.85 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  27.22 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.69 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.28 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.08 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubiE  30.25 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.22 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2118  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.25 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.73 
 
 		 266 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.32 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.54 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.69 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>