48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03940 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  100 
 
 
284 aa  583  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  56.34 
 
 
268 aa  319  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  45.61 
 
 
282 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  48 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  44.13 
 
 
270 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  43.06 
 
 
287 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  47.79 
 
 
289 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  45.26 
 
 
282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  42.96 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  42.96 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  42.86 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  46.07 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  45.13 
 
 
278 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  42.96 
 
 
270 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  45.55 
 
 
276 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  48.57 
 
 
267 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  42.61 
 
 
270 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  41.43 
 
 
270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  41.43 
 
 
270 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  45.2 
 
 
276 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  41.07 
 
 
270 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  45.02 
 
 
284 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  50.43 
 
 
332 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  45.31 
 
 
310 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  46.64 
 
 
285 aa  202  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  45.25 
 
 
332 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  42.45 
 
 
298 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  41.6 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  39.84 
 
 
290 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  42.04 
 
 
294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  43.08 
 
 
288 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  42.63 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  34.13 
 
 
284 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  33.1 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  33.57 
 
 
254 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  30.92 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  29.92 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  28.69 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  24.81 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  27.57 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  27.88 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  23.53 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  26.72 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  24.8 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  24.8 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
208 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>