49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1215 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  565  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  54.15 
 
 
288 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  48.65 
 
 
284 aa  221  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  49.79 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  48.05 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  49.6 
 
 
332 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  46.3 
 
 
278 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  43.3 
 
 
290 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  45 
 
 
276 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  45.24 
 
 
282 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  41.91 
 
 
270 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  43.38 
 
 
270 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  42.91 
 
 
276 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  43.38 
 
 
270 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  43.38 
 
 
270 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  45.53 
 
 
294 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  45.1 
 
 
298 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  45.38 
 
 
289 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  43.01 
 
 
270 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  46.61 
 
 
267 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  41.03 
 
 
282 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  44.84 
 
 
276 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  43.16 
 
 
276 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  41.91 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  43.17 
 
 
270 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  45.31 
 
 
293 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  41.43 
 
 
270 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  45 
 
 
332 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  41.89 
 
 
287 aa  178  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  38.01 
 
 
268 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  35.71 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  31.76 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
241 aa  89.4  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  28.77 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  30.43 
 
 
281 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  29.12 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  30.19 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  29.64 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  30.95 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  30.08 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  28 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  27.2 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
201 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
411 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  28.33 
 
 
249 aa  49.3  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  24.37 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6182  hypothetical protein  24.85 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>