48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2108 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  73.45 
 
 		 276 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  71.38 
 
 		 276 aa  417  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  60.81 
 
 		 270 aa  347  9e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  60.44 
 
 		 270 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  60.07 
 
 		 270 aa  346  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  60.07 
 
 		 270 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  60.07 
 
 		 270 aa  343  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  59.71 
 
 		 270 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  59.71 
 
 		 270 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  63.89 
 
 		 282 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  59.34 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  59.34 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  57.66 
 
 		 289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  57.09 
 
 		 287 aa  331  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  56.41 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  51.64 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  49 
 
 		 332 aa  238  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  48.77 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  44.2 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  44.6 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  45.8 
 
 		 310 aa  218  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  45.55 
 
 		 284 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  48.96 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  47.28 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  44.53 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  44.53 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  40.29 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  43.51 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  40.29 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  42.14 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  46.61 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  39.2 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  30.37 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  95.9  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  31.75 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  28.05 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  24.19 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  26.07 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  27.73 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  25.47 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  26.57 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  26.11 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  23.45 
 
 		 201 aa  52  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  24.08 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  26.53 
 
 		 184 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>