53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3890 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  100 
 
 		 285 aa  583  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  62.59 
 
 		 284 aa  353  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  50.54 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  46.89 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  47.45 
 
 		 276 aa  241  9e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  46.18 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  46.15 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  46.89 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  46.52 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  45.14 
 
 		 270 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  47.37 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  45.13 
 
 		 276 aa  238  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  46.13 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  48.4 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  44.32 
 
 		 270 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  44.69 
 
 		 270 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  44.32 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  50.2 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  43.96 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  49.6 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  47.37 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  45.52 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  48.18 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  47.6 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  42.51 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  48.78 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  46.67 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  45.55 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  45.93 
 
 		 293 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  47.64 
 
 		 268 aa  205  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  44.35 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  42.07 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  38.46 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  33.57 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  27.84 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  29.76 
 
 		 281 aa  85.5  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  28.97 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  27.96 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  28.46 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  27.45 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  26.92 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  28.52 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  25.73 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  24.39 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  26 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  24.41 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  26.61 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  24.12 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  22.55 
 
 		 397 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>