48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1862 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  98.89 
 
 
270 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  98.52 
 
 
270 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  97.78 
 
 
270 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  86.25 
 
 
270 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  85.87 
 
 
270 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  85.87 
 
 
270 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  84.76 
 
 
270 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  85.13 
 
 
270 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  60.44 
 
 
276 aa  346  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  60.14 
 
 
276 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  60.71 
 
 
289 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  59.34 
 
 
276 aa  332  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  60.31 
 
 
282 aa  326  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  62.86 
 
 
287 aa  326  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  55.72 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  52.42 
 
 
284 aa  255  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  48.33 
 
 
278 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  46.94 
 
 
285 aa  228  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  45.93 
 
 
332 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  44.49 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  42.96 
 
 
284 aa  219  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  43.72 
 
 
290 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  49.17 
 
 
332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  45.05 
 
 
268 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  43.43 
 
 
298 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  45.93 
 
 
267 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  43.82 
 
 
294 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  44.35 
 
 
293 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  43.53 
 
 
288 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  44.71 
 
 
310 aa  200  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  44 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  34.69 
 
 
284 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  28.37 
 
 
254 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  32.98 
 
 
254 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  29.25 
 
 
281 aa  79  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  27.17 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  23.9 
 
 
251 aa  62.4  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  24.12 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  22.02 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  25.96 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  26.67 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  28.29 
 
 
247 aa  53.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  26.03 
 
 
258 aa  52.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  24.77 
 
 
249 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  24.9 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  24.68 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  24.27 
 
 
397 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>