47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1436 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  88.59 
 
 		 298 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  67.15 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  47.54 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  44.83 
 
 		 290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  46.88 
 
 		 284 aa  235  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  46.4 
 
 		 278 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  49.81 
 
 		 285 aa  228  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  43.57 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  43.93 
 
 		 270 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  43.57 
 
 		 270 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  43.73 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  46.37 
 
 		 332 aa  218  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  49.57 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  48.97 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  42.91 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  43.17 
 
 		 270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  42.26 
 
 		 270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  49.04 
 
 		 288 aa  212  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  43.17 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  43.17 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  42.45 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  42.18 
 
 		 276 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  45.97 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  48.97 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  45.9 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  43.15 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  40 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  42.75 
 
 		 276 aa  202  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  40.07 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  40.29 
 
 		 284 aa  189  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  44.76 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  40.96 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  34.3 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  31.21 
 
 		 254 aa  99.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  30.13 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  29.72 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  27.45 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  25.51 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  30.86 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  29.84 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  26.67 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  28.23 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  23.32 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  22.95 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>