50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0267 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  558  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  56.34 
 
 		 284 aa  325  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  45.79 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  48.4 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  48.35 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  46.89 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  48.31 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  45.79 
 
 		 270 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  46.47 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  45.79 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  45.79 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  45.42 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  45.05 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  50 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  45.05 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  45.42 
 
 		 270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  46.8 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  45.78 
 
 		 298 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  48.09 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  45.53 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  45.49 
 
 		 293 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  45 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  42.86 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  45.38 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  43.28 
 
 		 276 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  46.67 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  41.26 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  42.14 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  41.92 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  42.86 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  39.69 
 
 		 332 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  40.34 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  35.92 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  34.39 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  29.64 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  31 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  30.15 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  30.29 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  27.31 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  25.72 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  25.51 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  26.97 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  25.1 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  25.91 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  25 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  24.02 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  23.62 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  25.39 
 
 		 186 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  23.16 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  21.55 
 
 		 210 aa  42  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>